More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2808 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  100 
 
 
385 aa  793    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  74.48 
 
 
386 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  64.32 
 
 
385 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  64.32 
 
 
385 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  60.9 
 
 
388 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  53.37 
 
 
384 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 
384 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  47.72 
 
 
389 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.21 
 
 
388 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.62 
 
 
379 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.55 
 
 
391 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.24 
 
 
389 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.64 
 
 
387 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.64 
 
 
387 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.38 
 
 
387 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.56 
 
 
403 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  47.79 
 
 
387 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.7 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.7 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.7 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  46.97 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.44 
 
 
394 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  47.93 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  45.77 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.07 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.54 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.83 
 
 
387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  46.34 
 
 
387 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  47.93 
 
 
387 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  45.81 
 
 
387 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.17 
 
 
394 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.44 
 
 
396 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  46.44 
 
 
396 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  46.44 
 
 
396 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  46.44 
 
 
396 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  46.44 
 
 
396 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  46.44 
 
 
396 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.02 
 
 
387 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  46.44 
 
 
396 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  44.65 
 
 
395 aa  333  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.8 
 
 
406 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 
398 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.46 
 
 
401 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  44.41 
 
 
396 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  45.65 
 
 
394 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  44.41 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.14 
 
 
388 aa  332  8e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  43.92 
 
 
397 aa  332  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  44.88 
 
 
396 aa  332  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  46.34 
 
 
387 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.72 
 
 
402 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  44.41 
 
 
396 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  45.36 
 
 
389 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  46.77 
 
 
387 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  44.71 
 
 
397 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  44.18 
 
 
399 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  48.91 
 
 
385 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  48.56 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  48.53 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.5 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  49.73 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  50 
 
 
385 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  45.89 
 
 
389 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  44.97 
 
 
387 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  45.45 
 
 
388 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  46.48 
 
 
389 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  45.03 
 
 
387 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.61 
 
 
404 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  45.45 
 
 
388 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.3 
 
 
397 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  45.79 
 
 
397 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.88 
 
 
387 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.62 
 
 
387 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 
379 aa  323  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  46.07 
 
 
388 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  46.07 
 
 
387 aa  322  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  45.84 
 
 
388 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  46.77 
 
 
389 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  45.74 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  44.74 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  45.79 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  44.42 
 
 
415 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  45.53 
 
 
405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  44.42 
 
 
415 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  44.42 
 
 
396 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  46.68 
 
 
389 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  46.4 
 
 
392 aa  319  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  44.97 
 
 
399 aa  319  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.56 
 
 
390 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  45.38 
 
 
388 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.67 
 
 
425 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  45.24 
 
 
382 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  43.5 
 
 
398 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  43.65 
 
 
396 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.39 
 
 
388 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  44.68 
 
 
392 aa  315  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  45.41 
 
 
397 aa  315  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  43.4 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  47.17 
 
 
389 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>