More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1216 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  100 
 
 		 386 aa  792    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  74.48 
 
 		 385 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  64.68 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  61.94 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  64.94 
 
 		 385 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  53.66 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  52.13 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.59 
 
 		 389 aa  358  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  47.21 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  44.71 
 
 		 397 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.21 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.26 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  49.05 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.68 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.06 
 
 		 402 aa  338  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  47.63 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  43.95 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.53 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.57 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  46.68 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  44.36 
 
 		 382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  43.77 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.11 
 
 		 401 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  44.13 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.44 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.01 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  43.26 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  47.14 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  47.14 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.74 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  44.44 
 
 		 423 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  42.46 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  46.87 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  47.4 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  44.82 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  48.04 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.59 
 
 		 379 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  45.78 
 
 		 395 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  45.95 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  45.43 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  44.88 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  44.88 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.62 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  44.3 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  45.5 
 
 		 395 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  45.33 
 
 		 394 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  45.33 
 
 		 394 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.79 
 
 		 385 aa  325  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  45.33 
 
 		 394 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  44.62 
 
 		 387 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.42 
 
 		 390 aa  325  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.83 
 
 		 415 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  45.72 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  43.12 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.83 
 
 		 415 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  48.78 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.24 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  42.68 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  45.48 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.83 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.77 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  45.58 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  46.49 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.49 
 
 		 391 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.96 
 
 		 385 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  44.97 
 
 		 396 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  43.95 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  43.57 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  44.38 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  48.53 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  45.83 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.16 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  43.57 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.56 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  45.41 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.56 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  45.81 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  47.98 
 
 		 373 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.09 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  43.57 
 
 		 392 aa  318  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  44.5 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  43.26 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  46.24 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  42.86 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  44.09 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  43.24 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  46.49 
 
 		 397 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  45.53 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  46.95 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.65 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  45.24 
 
 		 388 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  43.65 
 
 		 398 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.97 
 
 		 387 aa  315  8e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  44.03 
 
 		 408 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>