More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2027 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  100 
 
 		 382 aa  793    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  73.16 
 
 		 384 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  73.42 
 
 		 384 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  59.04 
 
 		 376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  55.99 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  50.91 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  53.62 
 
 		 387 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  51.31 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  50.65 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 		 391 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.79 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.83 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.79 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.01 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.27 
 
 		 397 aa  361  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.95 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47 
 
 		 423 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.48 
 
 		 398 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 398 aa  348  9e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  45.83 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  45.83 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  45.83 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.23 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  49.08 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  45.57 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  45.57 
 
 		 399 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  45.97 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.65 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.39 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.6 
 
 		 401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.76 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.82 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  45.26 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  47.51 
 
 		 386 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.19 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  44.36 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  45.26 
 
 		 386 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  45.03 
 
 		 381 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  45.67 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.43 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.14 
 
 		 401 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.68 
 
 		 404 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  44.01 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  44.88 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.03 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  42.22 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  42.74 
 
 		 394 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  43.39 
 
 		 389 aa  326  5e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  46.28 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  44.09 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  43.54 
 
 		 379 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  41.69 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  41.69 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  42.48 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  41.69 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  41.69 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.69 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  42.55 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  41.69 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  41.69 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  45.5 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  42.55 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  42.55 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  42.22 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  43.83 
 
 		 399 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  44.83 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  41.95 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  41.95 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  41.95 
 
 		 394 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  42.22 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  44.85 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  43.35 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  44.83 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  43.62 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  42.37 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  44.09 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  42.97 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  44.3 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  43.01 
 
 		 396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  44.3 
 
 		 399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  44.3 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  44.01 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  44.68 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41.64 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  43.42 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  43.27 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  44.03 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  43.85 
 
 		 386 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  41.13 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  43.54 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  43.54 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  44.33 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  42.22 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  43.31 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  43.01 
 
 		 387 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  41.93 
 
 		 405 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>