More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5455 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  93.38 
 
 		 394 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  804    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  93.61 
 
 		 391 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  93.38 
 
 		 394 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  93.38 
 
 		 394 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  97.46 
 
 		 394 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  81.61 
 
 		 387 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  50.65 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  51.72 
 
 		 376 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  52.58 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.71 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  51.06 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 		 397 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.61 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  50.13 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  50.13 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.2 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.62 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.09 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.83 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  49.23 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.01 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.62 
 
 		 401 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.23 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.25 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.88 
 
 		 399 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.41 
 
 		 389 aa  349  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.88 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.8 
 
 		 425 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.49 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.88 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.88 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.46 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.75 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.68 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.09 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.19 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.51 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  46.07 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.97 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  48.03 
 
 		 384 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.47 
 
 		 399 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 399 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  51.62 
 
 		 338 aa  338  8e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.47 
 
 		 396 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.74 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.94 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.7 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.59 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  48.44 
 
 		 393 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.47 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.94 
 
 		 388 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.2 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  51.32 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  47.66 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.4 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.81 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  49.73 
 
 		 381 aa  332  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.93 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.73 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.19 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  47.77 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.14 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.41 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.68 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  46.17 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.68 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.68 
 
 		 396 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  46.61 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.56 
 
 		 385 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.81 
 
 		 394 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.63 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  46.91 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.66 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.29 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.32 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.18 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  47.37 
 
 		 387 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.18 
 
 		 379 aa  325  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.37 
 
 		 387 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.37 
 
 		 387 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.05 
 
 		 387 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  46.61 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  47.4 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.31 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  46.51 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>