More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4917 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 376 aa  779    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  71.77 
 
 		 338 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  59.04 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  59.09 
 
 		 384 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  59.36 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  50.79 
 
 		 394 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  51.72 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  51.59 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.94 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.4 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  50.54 
 
 		 387 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.68 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.93 
 
 		 423 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 397 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  48.66 
 
 		 398 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.15 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.64 
 
 		 415 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.64 
 
 		 415 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.64 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.01 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.01 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  45.95 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.07 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  46.79 
 
 		 396 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.17 
 
 		 396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.35 
 
 		 397 aa  338  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  45.43 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  45.81 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  44.53 
 
 		 394 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  45.55 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  45.55 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  45.55 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  46.81 
 
 		 391 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  45.55 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  45.55 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  45.55 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.55 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  44.27 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  46.74 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  44.27 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  44.2 
 
 		 394 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  43.73 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  43.73 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  43.73 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.76 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  46.67 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  46.65 
 
 		 384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.83 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.83 
 
 		 387 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  46.01 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  47.87 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  44.44 
 
 		 401 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  46.54 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  45.91 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  45.9 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  45.58 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  48.28 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  43.62 
 
 		 385 aa  322  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.09 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  43.57 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  44.56 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.03 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  45.62 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  44.79 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  43.31 
 
 		 401 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  44.56 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  45.08 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  47.24 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  44.39 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2995  amidohydrolase  46.26 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.505357  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  44.5 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  45.36 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  43.87 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  44.26 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  44.26 
 
 		 396 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.54 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  44.26 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  44.84 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  45.43 
 
 		 386 aa  312  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  45.62 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  44.54 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  43.58 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  44.65 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  42.67 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  43.12 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.09 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  44.26 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  43.12 
 
 		 388 aa  309  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  45.95 
 
 		 388 aa  308  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  42.43 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.7 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.7 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  43.28 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>