More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4907 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  93.38 
 
 		 394 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  97.46 
 
 		 394 aa  759    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  92.84 
 
 		 391 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  92.88 
 
 		 394 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  93.38 
 
 		 394 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  81.09 
 
 		 387 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  51.31 
 
 		 382 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  51.59 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  52.96 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 		 397 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  48.24 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.51 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.45 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.26 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  49.61 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  49.61 
 
 		 384 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  49.23 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.09 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.26 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.83 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.35 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  49.74 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.75 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.27 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.6 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.88 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.75 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.94 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.06 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.49 
 
 		 403 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.14 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.88 
 
 		 389 aa  345  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.72 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.35 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.03 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.46 
 
 		 401 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.73 
 
 		 396 aa  342  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.96 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.96 
 
 		 384 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.47 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.47 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.27 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.74 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.64 
 
 		 390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  48.7 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  48.04 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48.68 
 
 		 396 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  47.77 
 
 		 384 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.29 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.2 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.47 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  47.14 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  48.33 
 
 		 385 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  50.3 
 
 		 338 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  46.44 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.13 
 
 		 392 aa  332  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.93 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.4 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  48.79 
 
 		 381 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.55 
 
 		 396 aa  329  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.28 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.28 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.28 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.14 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  48.44 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  48.15 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  47.64 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.81 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.03 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.41 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  47.37 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.6 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.6 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.66 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.33 
 
 		 385 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.61 
 
 		 388 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.65 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.18 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.57 
 
 		 389 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  47.77 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.05 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.35 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.11 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.35 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.35 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.11 
 
 		 387 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.58 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>