More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5231 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  96.95 
 
 
394 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  93.38 
 
 
394 aa  736    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  93.08 
 
 
391 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  100 
 
 
394 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
394 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  93.38 
 
 
394 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  78.96 
 
 
387 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  50.79 
 
 
382 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  50.79 
 
 
376 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.53 
 
 
402 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  50.13 
 
 
403 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.05 
 
 
397 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  52.47 
 
 
386 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  49.08 
 
 
384 aa  362  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  49.08 
 
 
384 aa  361  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.57 
 
 
396 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.74 
 
 
397 aa  361  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.53 
 
 
397 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.31 
 
 
396 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  50.39 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.88 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.63 
 
 
399 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.27 
 
 
398 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.88 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.32 
 
 
425 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.53 
 
 
396 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.25 
 
 
404 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.75 
 
 
423 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.88 
 
 
387 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.68 
 
 
395 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.98 
 
 
401 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.77 
 
 
397 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.88 
 
 
387 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.35 
 
 
389 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.72 
 
 
401 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.03 
 
 
397 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 
425 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.87 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.31 
 
 
396 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.94 
 
 
384 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.44 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 
396 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.19 
 
 
388 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  48.03 
 
 
384 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.75 
 
 
391 aa  338  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.88 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.16 
 
 
396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.56 
 
 
385 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.61 
 
 
388 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  47.89 
 
 
399 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  49.11 
 
 
338 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  49.87 
 
 
390 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  47.89 
 
 
399 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  48.66 
 
 
381 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.16 
 
 
396 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  47 
 
 
396 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.49 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.49 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 
394 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.88 
 
 
401 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.07 
 
 
388 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  46.61 
 
 
387 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  45.91 
 
 
387 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  44.5 
 
 
390 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.86 
 
 
394 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.76 
 
 
396 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.76 
 
 
396 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.76 
 
 
396 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.76 
 
 
396 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.76 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.76 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.35 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  47.88 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.76 
 
 
396 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  47.4 
 
 
387 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.6 
 
 
396 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 
394 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.6 
 
 
399 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.53 
 
 
385 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.84 
 
 
387 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.14 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.59 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.35 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.49 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.35 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  45.57 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.35 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  45.95 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.35 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  46.72 
 
 
393 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  46.75 
 
 
398 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.58 
 
 
387 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.58 
 
 
387 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.65 
 
 
379 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  46.55 
 
 
402 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.49 
 
 
394 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  48.27 
 
 
385 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  44.76 
 
 
389 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  45.05 
 
 
387 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.26 
 
 
387 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>