More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4601 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  93.08 
 
 		 391 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5455  amidohydrolase  93.38 
 
 		 394 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  96.95 
 
 		 394 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  96.95 
 
 		 394 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4907  amidohydrolase  92.88 
 
 		 394 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  79.17 
 
 		 387 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  50.91 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  50.79 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.31 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.53 
 
 		 402 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.76 
 
 		 403 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4779  amidohydrolase  52.71 
 
 		 386 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.0993236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0112  amidohydrolase  49.61 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.05 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4074  amidohydrolase  49.61 
 
 		 384 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.61 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.86 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.49 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.61 
 
 		 396 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0628  amidohydrolase  49.61 
 
 		 386 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.1 
 
 		 423 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  48.95 
 
 		 399 aa  349  6e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  47.01 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.15 
 
 		 389 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.1 
 
 		 401 aa  348  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.79 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  46.62 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.25 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.69 
 
 		 425 aa  347  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  47.01 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  46.72 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.7 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.16 
 
 		 395 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  46.46 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.87 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.58 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.7 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.05 
 
 		 396 aa  339  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.97 
 
 		 403 aa  338  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.28 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.69 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04931  amidohydrolase  50 
 
 		 338 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  49.49 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  47.27 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.16 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  48.15 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.2 
 
 		 391 aa  333  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4150  peptidase M20D, amidohydrolase  48.92 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.03 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  48.4 
 
 		 394 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.76 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.76 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.76 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  47.89 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  47.89 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.67 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  47.63 
 
 		 396 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  47.29 
 
 		 387 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  46.83 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.85 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  48.13 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.85 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.04 
 
 		 385 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  47.76 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  47.76 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  47.76 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.61 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  47 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.76 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  47.76 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.6 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  47.76 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  47.63 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  47.76 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  47.76 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.6 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  45.38 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  47.01 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.09 
 
 		 396 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  47.49 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.88 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  47.76 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  44.5 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.05 
 
 		 389 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.58 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.09 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  47.3 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.53 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  47.35 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  45.69 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 396 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  46.79 
 
 		 392 aa  322  6e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.65 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  46.39 
 
 		 402 aa  322  7e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.32 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  45.26 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.32 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>