More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6435 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  100 
 
 
395 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  84.05 
 
 
396 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  94.4 
 
 
395 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  99.49 
 
 
395 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
395 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  93.89 
 
 
395 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  52.78 
 
 
404 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  52.42 
 
 
403 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  50.65 
 
 
401 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  50.87 
 
 
425 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  50.39 
 
 
401 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  50.89 
 
 
397 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.37 
 
 
396 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 
397 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.12 
 
 
396 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  51.15 
 
 
401 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.37 
 
 
396 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  50.26 
 
 
398 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.6 
 
 
398 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.73 
 
 
396 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.26 
 
 
402 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
389 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  54.88 
 
 
390 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.44 
 
 
397 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.84 
 
 
397 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.98 
 
 
398 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.23 
 
 
423 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.36 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.85 
 
 
415 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.85 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  47.58 
 
 
397 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.85 
 
 
415 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.72 
 
 
399 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.35 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  49.2 
 
 
395 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  48.3 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.04 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 
397 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  48.85 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.97 
 
 
379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  49.47 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.4 
 
 
392 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  49.47 
 
 
399 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.52 
 
 
390 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
399 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.34 
 
 
389 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  48.67 
 
 
396 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.13 
 
 
388 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.2 
 
 
396 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.65 
 
 
387 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.2 
 
 
396 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  52.29 
 
 
384 aa  349  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  50.92 
 
 
396 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.31 
 
 
387 aa  348  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  45.05 
 
 
399 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.11 
 
 
387 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.11 
 
 
387 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  47.03 
 
 
389 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  46.7 
 
 
425 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.82 
 
 
399 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  44.53 
 
 
393 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 
396 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.21 
 
 
396 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  45.04 
 
 
387 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.58 
 
 
387 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  46.54 
 
 
396 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  45.04 
 
 
387 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.62 
 
 
402 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  46.51 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  50.67 
 
 
388 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  49.36 
 
 
389 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.84 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.04 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  46.38 
 
 
387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.77 
 
 
387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.56 
 
 
389 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  49.87 
 
 
373 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  47.06 
 
 
390 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.4 
 
 
388 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  47.14 
 
 
386 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.34 
 
 
405 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  49.86 
 
 
385 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  49.33 
 
 
390 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 
382 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.38 
 
 
387 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.16 
 
 
394 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.03 
 
 
388 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  47.38 
 
 
387 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  49.06 
 
 
387 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  45.7 
 
 
394 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.81 
 
 
391 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  45.99 
 
 
399 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  46.67 
 
 
401 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  46.65 
 
 
404 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.7 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  46.51 
 
 
387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  45.05 
 
 
412 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  43.86 
 
 
396 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  47.52 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  45.72 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>