More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3523 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  95.58 
 
 		 385 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  793    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  64.68 
 
 		 386 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  64.32 
 
 		 385 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  60.42 
 
 		 388 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  53.52 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  54.91 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.07 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  52.7 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.28 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  51.05 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.41 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.42 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  49.6 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  50.78 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.56 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  47.92 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  47.92 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  49.61 
 
 		 387 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  47.24 
 
 		 396 aa  362  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.6 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  50.39 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.45 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.61 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  49.34 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.89 
 
 		 401 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.83 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  49.07 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.09 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  47.61 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.09 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.09 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.63 
 
 		 401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.09 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.09 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.09 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  47.85 
 
 		 401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.66 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.09 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  50.39 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  49.46 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  46.12 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.12 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.46 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.21 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.82 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  48.14 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  48.81 
 
 		 387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  49.6 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  48.82 
 
 		 387 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 		 391 aa  352  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  52.01 
 
 		 385 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  48.97 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.19 
 
 		 394 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.65 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.65 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.65 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.23 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  49.6 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.25 
 
 		 402 aa  349  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  52.24 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  51.46 
 
 		 385 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  48.56 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  48.55 
 
 		 390 aa  349  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.48 
 
 		 403 aa  348  7e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  47.48 
 
 		 387 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.21 
 
 		 390 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  48.29 
 
 		 388 aa  348  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  51.46 
 
 		 385 aa  348  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  48.43 
 
 		 424 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.82 
 
 		 387 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  48.52 
 
 		 379 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.55 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.3 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.3 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.3 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.07 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.55 
 
 		 387 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  47.48 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  48.96 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  49.33 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50.13 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.04 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.24 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.55 
 
 		 387 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  48.24 
 
 		 391 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.04 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.15 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.35 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  47.35 
 
 		 388 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  49.47 
 
 		 388 aa  338  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  48.03 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  48.03 
 
 		 408 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>