More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4256 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  100 
 
 		 392 aa  800    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.2 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  52.24 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  52.24 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  50.13 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  48.95 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  48.95 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  49.6 
 
 		 390 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.31 
 
 		 402 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  48.16 
 
 		 397 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  48.03 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.4 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  48.13 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  49.47 
 
 		 408 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  52.27 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  49.34 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  49.47 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  48.04 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.04 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  45.71 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  48.42 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.26 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.53 
 
 		 389 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.74 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  49.08 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  51.72 
 
 		 390 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.93 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  47.51 
 
 		 408 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  51.07 
 
 		 390 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  50.4 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.92 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.67 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.23 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  45.95 
 
 		 398 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.74 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  47.58 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.69 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  48.83 
 
 		 388 aa  342  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.07 
 
 		 388 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  48.05 
 
 		 415 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  48.05 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  48.05 
 
 		 415 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  48.04 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  51.72 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.26 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  47.27 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  47.61 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  45.26 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  46.42 
 
 		 387 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.89 
 
 		 397 aa  336  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.53 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  47.01 
 
 		 399 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  48.44 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  49.05 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.42 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.44 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  45.62 
 
 		 390 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  48.93 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  46.93 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  45.14 
 
 		 447 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.62 
 
 		 387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.21 
 
 		 379 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.27 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  45.89 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.95 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  48.4 
 
 		 389 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  45.75 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.89 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  47.59 
 
 		 387 aa  326  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  46.24 
 
 		 387 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  45.14 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  44.68 
 
 		 385 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  43.32 
 
 		 388 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.43 
 
 		 387 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.24 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  48 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  47.04 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  43.57 
 
 		 386 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.76 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.19 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  46.51 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  47.27 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  46.24 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  46.09 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  45.24 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  45.31 
 
 		 387 aa  318  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  45.69 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  44.18 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  48.8 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  46.11 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.24 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  46.83 
 
 		 395 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  46.87 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  45.33 
 
 		 389 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>