More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0512 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 379 aa  768    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  52.82 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  49.87 
 
 		 384 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  48.13 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.67 
 
 		 387 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.4 
 
 		 387 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  50.13 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 		 387 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  48.39 
 
 		 387 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.61 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.61 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  49.22 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  49.22 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.22 
 
 		 396 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  47.98 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  47.98 
 
 		 387 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.41 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  47.21 
 
 		 399 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  49.07 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.92 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.74 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.21 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  45.27 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.2 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  47.45 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.65 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.95 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.38 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.12 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  47.33 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  46.74 
 
 		 397 aa  325  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  46.63 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  46.84 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.26 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  46.15 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  46.58 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  46.21 
 
 		 396 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.69 
 
 		 396 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.69 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  48.94 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  44.74 
 
 		 397 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  47.33 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.56 
 
 		 401 aa  319  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  44.68 
 
 		 412 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.99 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.85 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  47.83 
 
 		 388 aa  316  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  45.62 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  44.33 
 
 		 403 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  45.67 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.81 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  45.82 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  46.15 
 
 		 386 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  45.82 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.81 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  46.58 
 
 		 384 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  45.82 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  45.31 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  45.97 
 
 		 395 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  48.94 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  44.59 
 
 		 387 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  46.28 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  45.24 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  45.14 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  48.71 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  45.24 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  47.07 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  47.59 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  47.07 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  47.33 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.63 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.95 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.75 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  49.21 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  47.98 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  45.03 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  44.99 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  47.3 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.72 
 
 		 392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  45.43 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  45.88 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  45.88 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  45.63 
 
 		 396 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  45.75 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  45.6 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.43 
 
 		 406 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  47.37 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  46.7 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  46.3 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  46.7 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  45.36 
 
 		 396 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  48.1 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  45.13 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  46.7 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  44.27 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  45.05 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  45.38 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>