More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5224 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  100 
 
 		 401 aa  818    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  70.32 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  57.43 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  57.43 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  57.43 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  57.85 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  56.17 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  54 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  54.16 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  54.91 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  54 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  54 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  55.03 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  53 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  53.15 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  52.91 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  53.23 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  55.92 
 
 		 399 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  56.17 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  52.38 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  53.25 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  56.17 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  53.63 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  56.17 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  55.42 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  53.5 
 
 		 401 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  53.25 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  52.5 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  52.45 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.86 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.86 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  48.72 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.61 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.61 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.61 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.86 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.86 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.86 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  48.72 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  49.74 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.11 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  48.72 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.62 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  48.72 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  48.72 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.61 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  47.36 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  47.36 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.59 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  47.36 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.34 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  47.69 
 
 		 387 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.63 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.31 
 
 		 412 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  52.51 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.63 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  46.48 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  46.73 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  49.37 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.3 
 
 		 395 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  49.61 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  45.59 
 
 		 387 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  49.61 
 
 		 389 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  49.48 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.56 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.59 
 
 		 387 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  47.34 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  48.61 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  47.34 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.6 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  47.34 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  47.09 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  46.08 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  49.11 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  48.58 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  46.37 
 
 		 402 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.33 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  48.32 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  45.83 
 
 		 401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  46.1 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  51.68 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  51.68 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  45.74 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  51.68 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  47.68 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  45.92 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  44.72 
 
 		 406 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  48.82 
 
 		 391 aa  335  9e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  45.66 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  47.29 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  45.92 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  45.92 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  48.45 
 
 		 395 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.86 
 
 		 385 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  45.92 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  44.78 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  47.16 
 
 		 404 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  47.16 
 
 		 404 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>