More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1211 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  100 
 
 
384 aa  785    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.34 
 
 
388 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  46.61 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  46.49 
 
 
389 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.85 
 
 
389 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  48.4 
 
 
384 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  45.38 
 
 
412 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.58 
 
 
403 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.3 
 
 
398 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  48.04 
 
 
390 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.18 
 
 
389 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.11 
 
 
379 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.03 
 
 
390 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 
390 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  43.26 
 
 
396 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.07 
 
 
387 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  46.49 
 
 
415 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  46.49 
 
 
415 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  46.49 
 
 
396 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  45.81 
 
 
389 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  46.24 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  45.89 
 
 
387 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  45.09 
 
 
387 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  46.61 
 
 
399 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  46.35 
 
 
396 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.69 
 
 
397 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  44.15 
 
 
397 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  44.56 
 
 
387 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.56 
 
 
387 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.36 
 
 
397 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  46.97 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  45.03 
 
 
389 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  46.58 
 
 
394 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  47.54 
 
 
398 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  45.48 
 
 
395 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  45.77 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  45.09 
 
 
387 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  45.09 
 
 
387 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  44.44 
 
 
404 aa  318  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.34 
 
 
387 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.62 
 
 
387 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  48.28 
 
 
390 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  46.03 
 
 
401 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  46.13 
 
 
399 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  46.38 
 
 
387 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  46.97 
 
 
394 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  46.17 
 
 
394 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  46.17 
 
 
394 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  45.22 
 
 
395 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  46.17 
 
 
394 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  46.44 
 
 
394 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  42.89 
 
 
396 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  46.44 
 
 
394 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  45.38 
 
 
395 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45 
 
 
406 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  44.44 
 
 
403 aa  315  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  45.21 
 
 
391 aa  315  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  44.28 
 
 
447 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  42.64 
 
 
396 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.22 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  43.95 
 
 
401 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.81 
 
 
402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  45.31 
 
 
396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  44.03 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  43.68 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  46.05 
 
 
389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  44.97 
 
 
398 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  47.2 
 
 
389 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  45.26 
 
 
389 aa  311  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  44.68 
 
 
425 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  45.6 
 
 
399 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  45.91 
 
 
396 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  46.61 
 
 
396 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  44.03 
 
 
425 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  43.65 
 
 
397 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  43.77 
 
 
396 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.8 
 
 
399 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  43.78 
 
 
415 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  44.71 
 
 
423 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3165  amidohydrolase  44.44 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  45.45 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  45.41 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  44.71 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 
395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  45.45 
 
 
395 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  45.12 
 
 
405 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 
385 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  46.89 
 
 
388 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  45.09 
 
 
389 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  46.19 
 
 
408 aa  309  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  45.38 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  45.38 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  45.38 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  45.38 
 
 
396 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  45.53 
 
 
396 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  45.38 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.38 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  46.17 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  45.38 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  44.39 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>