More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2179 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  100 
 
 
393 aa  783    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  74.41 
 
 
385 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  59.9 
 
 
382 aa  425  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.58 
 
 
389 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  47.92 
 
 
397 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.01 
 
 
397 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  52.73 
 
 
384 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  48.16 
 
 
401 aa  358  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  45.85 
 
 
396 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  45.45 
 
 
396 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  45.6 
 
 
396 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  47.31 
 
 
397 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
384 aa  345  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  45.97 
 
 
404 aa  345  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  46.49 
 
 
388 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  45.99 
 
 
387 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  47.84 
 
 
408 aa  342  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  44.88 
 
 
398 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.29 
 
 
412 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  46.35 
 
 
396 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  46.63 
 
 
398 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  48.72 
 
 
402 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  46.63 
 
 
423 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  45.97 
 
 
397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.61 
 
 
388 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  46.72 
 
 
379 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  46.35 
 
 
403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  45.41 
 
 
401 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  50.13 
 
 
390 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  44.53 
 
 
402 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  45.14 
 
 
401 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  44.88 
 
 
397 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  48.29 
 
 
395 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  46.29 
 
 
397 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  48.72 
 
 
408 aa  332  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  48.72 
 
 
408 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  48.44 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  48.95 
 
 
386 aa  332  8e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  47.62 
 
 
395 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  44.5 
 
 
403 aa  332  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  47.24 
 
 
401 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  44.67 
 
 
389 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  47.35 
 
 
395 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  48.62 
 
 
398 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  47.35 
 
 
395 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.57 
 
 
388 aa  330  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  46.51 
 
 
389 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  46.92 
 
 
415 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.44 
 
 
399 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  44.96 
 
 
387 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.39 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  47.79 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  48.22 
 
 
385 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.22 
 
 
388 aa  329  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  49.36 
 
 
385 aa  329  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  47.79 
 
 
415 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  47.79 
 
 
415 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  49.62 
 
 
385 aa  328  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  47.27 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.94 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  44.94 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  47.76 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  45.48 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  47.21 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  43.98 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  44.82 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  45.01 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.62 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.48 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  44.56 
 
 
387 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  44.53 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  45.22 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  47.06 
 
 
390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.42 
 
 
395 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  45.8 
 
 
389 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  46.86 
 
 
396 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  49.34 
 
 
407 aa  325  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.12 
 
 
406 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  43.93 
 
 
390 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  46.8 
 
 
404 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  46.34 
 
 
385 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  44.96 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  45.99 
 
 
389 aa  324  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  44.96 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  44.96 
 
 
394 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  45.23 
 
 
396 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.55 
 
 
391 aa  322  7e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  44.44 
 
 
447 aa  322  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  45.93 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  44.13 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  45.69 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  47.01 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  44.42 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  44.68 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  48.28 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  45.02 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  43.65 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  47.26 
 
 
394 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  47.12 
 
 
392 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  47.26 
 
 
394 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>