More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4873 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  796    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  62.06 
 
 
387 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  51.19 
 
 
379 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  50.27 
 
 
388 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.73 
 
 
395 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.47 
 
 
396 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  51.2 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  52.12 
 
 
396 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.47 
 
 
425 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  51.2 
 
 
399 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  51.2 
 
 
399 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.66 
 
 
389 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.93 
 
 
396 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.06 
 
 
394 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  50.79 
 
 
396 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  49.87 
 
 
396 aa  362  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.52 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.08 
 
 
396 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.52 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.52 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  49.74 
 
 
387 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  49.73 
 
 
398 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  48.94 
 
 
387 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.93 
 
 
394 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  48.68 
 
 
387 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  48.68 
 
 
387 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  47.75 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  48.68 
 
 
387 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.47 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  45.12 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  48.3 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  49.21 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  44.91 
 
 
399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.98 
 
 
394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  48.4 
 
 
390 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  46.91 
 
 
388 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  47.72 
 
 
392 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.35 
 
 
394 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  47.88 
 
 
387 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  47.41 
 
 
406 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.52 
 
 
387 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.26 
 
 
387 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  46.01 
 
 
403 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  46.28 
 
 
412 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  46.26 
 
 
390 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  46.79 
 
 
389 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  49.6 
 
 
389 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  48.54 
 
 
395 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  48.66 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  48.66 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  50.66 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  49.48 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  45.03 
 
 
397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  50.67 
 
 
373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  47.09 
 
 
407 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  47.4 
 
 
393 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  47.16 
 
 
396 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  46.32 
 
 
405 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  45.08 
 
 
402 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  43.98 
 
 
397 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  46.65 
 
 
391 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  49.09 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  49.09 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  49.09 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  49.09 
 
 
395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  49.09 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  46.54 
 
 
395 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  48.83 
 
 
753 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  46.54 
 
 
395 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  46.54 
 
 
395 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  46.83 
 
 
406 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  45.78 
 
 
389 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  46.59 
 
 
391 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  43.72 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  45.04 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  47.7 
 
 
388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  44.13 
 
 
396 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  46.32 
 
 
391 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  43.31 
 
 
404 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  43.38 
 
 
387 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  42.86 
 
 
387 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  43.86 
 
 
396 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1812  amidohydrolase  45.5 
 
 
400 aa  315  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.34 
 
 
385 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  44.39 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  46.15 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  47.14 
 
 
394 aa  311  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  45.41 
 
 
387 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  43.83 
 
 
395 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  43.13 
 
 
386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  43.23 
 
 
395 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  43.04 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  43.04 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>