More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1190 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
394 aa  807    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  97.46 
 
 
394 aa  788    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  66.58 
 
 
393 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  65.14 
 
 
398 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  61.27 
 
 
393 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  61.3 
 
 
392 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  55.26 
 
 
386 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  53.95 
 
 
392 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  53.61 
 
 
394 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  52.82 
 
 
394 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 
392 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  51.58 
 
 
396 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  50.79 
 
 
400 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  49.47 
 
 
395 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  48.74 
 
 
398 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  49.74 
 
 
395 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  48.74 
 
 
398 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  41.99 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  38.77 
 
 
405 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.93 
 
 
390 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.16 
 
 
390 aa  272  9e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.02 
 
 
408 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  40.79 
 
 
396 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  41.08 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  40.26 
 
 
395 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.62 
 
 
381 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1971  peptidase M20D, amidohydrolase  55.42 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  37.37 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.28 
 
 
393 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  39.06 
 
 
400 aa  266  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.69 
 
 
391 aa  266  4e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  37.5 
 
 
412 aa  266  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.65 
 
 
403 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.45 
 
 
381 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  39.21 
 
 
394 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.43 
 
 
405 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  39.74 
 
 
397 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  38.44 
 
 
391 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  36.36 
 
 
440 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  37.1 
 
 
403 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  38.63 
 
 
381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  40.69 
 
 
393 aa  264  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  39.1 
 
 
399 aa  264  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  38.1 
 
 
381 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  36.43 
 
 
415 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  39.62 
 
 
388 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.69 
 
 
400 aa  261  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  40.05 
 
 
391 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  37.77 
 
 
399 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.36 
 
 
381 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.64 
 
 
379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  38.03 
 
 
418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.71 
 
 
387 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.79 
 
 
396 aa  259  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  40.49 
 
 
390 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.76 
 
 
415 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.75 
 
 
405 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.39 
 
 
389 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.56 
 
 
404 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.99 
 
 
396 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  39.95 
 
 
395 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.5 
 
 
459 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  36.84 
 
 
392 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.66 
 
 
401 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  38.15 
 
 
381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  37.33 
 
 
412 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  33.85 
 
 
420 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.1 
 
 
386 aa  255  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  40 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.33 
 
 
438 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38.4 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  36.15 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  38.44 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.52 
 
 
380 aa  252  7e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  37.63 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  32.91 
 
 
410 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.82 
 
 
391 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.3 
 
 
480 aa  252  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  38.05 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.82 
 
 
391 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  38.25 
 
 
398 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  37.23 
 
 
392 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  36.17 
 
 
384 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  36.74 
 
 
389 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  36.07 
 
 
387 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  35.4 
 
 
387 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  35.87 
 
 
480 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.3 
 
 
391 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  36.63 
 
 
387 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  36.63 
 
 
387 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.81 
 
 
405 aa  249  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  38.3 
 
 
391 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  38.52 
 
 
398 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  36.63 
 
 
387 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  37.79 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.79 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  34.51 
 
 
388 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.79 
 
 
391 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.36 
 
 
399 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  39.31 
 
 
389 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>