More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7287 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  100 
 
 		 391 aa  813    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  59.49 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  55.64 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  55.93 
 
 		 397 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  53.21 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  54.64 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  48.74 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  44.73 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  43.59 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  42.97 
 
 		 407 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  42.49 
 
 		 405 aa  341  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  42.89 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  41.84 
 
 		 408 aa  335  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  43.43 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  42.24 
 
 		 407 aa  329  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  41.91 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  41.05 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  43.9 
 
 		 408 aa  309  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  41.33 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40.84 
 
 		 405 aa  307  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  41.84 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  40.31 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  40.31 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  40.05 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.74 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.13 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  43.5 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  40.56 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  43.1 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  40.56 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.89 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.82 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.9 
 
 		 425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.79 
 
 		 405 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.16 
 
 		 405 aa  288  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.46 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  42.56 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  40.1 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.62 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.01 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.01 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  40.67 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.97 
 
 		 480 aa  282  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.82 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.44 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.23 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.08 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  38.17 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  39.29 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  37.34 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.54 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  40.64 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.66 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.36 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.36 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.36 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.95 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  41.95 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.74 
 
 		 387 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.84 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  37.76 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  40.84 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  38.36 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.49 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  39.85 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.93 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  42.49 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.39 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  38.9 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  39.18 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  40 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.37 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  39.05 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.37 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.18 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.9 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.53 
 
 		 397 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  38.36 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.9 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  36.03 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  38.9 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.27 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.9 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.36 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.19 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  40.17 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.69 
 
 		 466 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  37.01 
 
 		 396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  38.87 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  38.63 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  39.47 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  37.27 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  39.79 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  40.44 
 
 		 399 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  37.89 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  39.42 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  39.42 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  40.11 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>