More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1012 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  100 
 
 		 400 aa  797    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  71.83 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  51.88 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  48.43 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  48.43 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  46.67 
 
 		 405 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  46.89 
 
 		 405 aa  358  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  48.37 
 
 		 408 aa  355  6.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 		 405 aa  345  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  44.64 
 
 		 405 aa  344  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  49.1 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  45.85 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  47.96 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  42.04 
 
 		 391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  42.15 
 
 		 391 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.71 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  42.89 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.19 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.19 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  45.65 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  41.19 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  42.2 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  41.45 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.45 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  45.69 
 
 		 389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  41.16 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.45 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  47.31 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.72 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  40.16 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39.24 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.44 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  45.2 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  43.18 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  42.93 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.83 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.45 
 
 		 391 aa  299  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  41.48 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.85 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.07 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  44.56 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.02 
 
 		 380 aa  296  6e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  40.91 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  44.24 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  40.2 
 
 		 396 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  41.34 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  41.07 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  42.21 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  42.78 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  44.91 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  43.93 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  41.03 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  46.34 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.88 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  41.35 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.03 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  46.09 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  40.8 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  39.5 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  43.77 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  42.11 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  41.99 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  44 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  39.85 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  44.28 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.58 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41.53 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  43.12 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  41.25 
 
 		 397 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  44.59 
 
 		 389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  39.55 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  39.55 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  43.8 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  40.91 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  43.2 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  41.85 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  43.2 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38.54 
 
 		 449 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.39 
 
 		 396 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  43.32 
 
 		 379 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  42.64 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  41.01 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  43.26 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.68 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  45.29 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  44.99 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  40.24 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  44.39 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  38.6 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  41.37 
 
 		 439 aa  282  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.89 
 
 		 401 aa  282  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  43.4 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.52 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.56 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  40.56 
 
 		 395 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  43.85 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  42.26 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  39.39 
 
 		 413 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  40.66 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  41.01 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>