More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1044 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  834    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  67.4 
 
 
410 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  59.6 
 
 
407 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  59.01 
 
 
407 aa  481  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  58.91 
 
 
405 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  58.65 
 
 
404 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  58.04 
 
 
409 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  41.84 
 
 
391 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  46.97 
 
 
400 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  44.42 
 
 
401 aa  331  1e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  42.78 
 
 
400 aa  330  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  42.35 
 
 
390 aa  326  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  41.31 
 
 
395 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  43.91 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  45.09 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  41.69 
 
 
390 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.24 
 
 
393 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.44 
 
 
415 aa  286  5.999999999999999e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  42.9 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.37 
 
 
399 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  40.56 
 
 
400 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.49 
 
 
435 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.57 
 
 
391 aa  280  4e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  39.64 
 
 
396 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.66 
 
 
395 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 
392 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  37.31 
 
 
398 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.87 
 
 
394 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  37.5 
 
 
398 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  42.55 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.15 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.88 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  41.35 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  42.67 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  39.13 
 
 
398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  39.13 
 
 
398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  40.26 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  39.24 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  43.36 
 
 
379 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  39.24 
 
 
465 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 
405 aa  272  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  40.21 
 
 
399 aa  272  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.49 
 
 
466 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.99 
 
 
394 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  41.55 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.4 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  42.11 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  41.55 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.1 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  41.55 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  41.96 
 
 
392 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  39.65 
 
 
465 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.97 
 
 
381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  44.72 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  40.15 
 
 
431 aa  269  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.44 
 
 
389 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.82 
 
 
396 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  40.55 
 
 
407 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40 
 
 
388 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  38.48 
 
 
397 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  41.29 
 
 
394 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  39.43 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  39.39 
 
 
471 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  41.19 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  39.39 
 
 
471 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.27 
 
 
437 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  39.14 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.95 
 
 
400 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  41.29 
 
 
394 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  38.36 
 
 
389 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  41.55 
 
 
394 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  40.11 
 
 
405 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41.01 
 
 
389 aa  265  8e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  37.19 
 
 
399 aa  265  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  38.89 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  38.36 
 
 
389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.66 
 
 
397 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  38.62 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.62 
 
 
389 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.62 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  38.62 
 
 
389 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.58 
 
 
380 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.67 
 
 
406 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  40.22 
 
 
399 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  41.08 
 
 
458 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.62 
 
 
389 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  40.75 
 
 
394 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  38.76 
 
 
447 aa  263  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  39.53 
 
 
391 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  37.72 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  42.42 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  40.16 
 
 
389 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  40.55 
 
 
391 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  40.96 
 
 
387 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  40.96 
 
 
387 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.09 
 
 
438 aa  262  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.96 
 
 
387 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.83 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  38.05 
 
 
397 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.11 
 
 
389 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>