More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0180 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
393 aa  764    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  47.99 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  43.77 
 
 
390 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  46.77 
 
 
387 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  48.26 
 
 
395 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  48.12 
 
 
386 aa  330  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.39 
 
 
388 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  50.14 
 
 
394 aa  326  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  48.39 
 
 
388 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  47.58 
 
 
385 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  46.58 
 
 
389 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  47.06 
 
 
387 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.59 
 
 
388 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  48.92 
 
 
385 aa  322  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  49.74 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  47.06 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  46.11 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  45.53 
 
 
403 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  47.15 
 
 
389 aa  319  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  48.35 
 
 
411 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  48.66 
 
 
385 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  50 
 
 
399 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  46.52 
 
 
387 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  42.78 
 
 
403 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  42.78 
 
 
403 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  49.73 
 
 
388 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  42.16 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  43.24 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.59 
 
 
389 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  45.38 
 
 
404 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  46.89 
 
 
394 aa  311  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  46.49 
 
 
386 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  44.15 
 
 
379 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  47.73 
 
 
388 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  45.09 
 
 
408 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  44.96 
 
 
396 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.63 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.32 
 
 
388 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  42.97 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  47.27 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.41 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  45.16 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  46.24 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  44.12 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  47.18 
 
 
384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  42.45 
 
 
396 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  43.8 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  46.06 
 
 
399 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  41.44 
 
 
405 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  47.55 
 
 
395 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  45.78 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  43.62 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  45.78 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  45.28 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  46.68 
 
 
386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  40.15 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  46.3 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  44.35 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  41.88 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  41.11 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  46.51 
 
 
388 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  45.58 
 
 
390 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  40.26 
 
 
396 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  41.88 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  46.09 
 
 
389 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  44.57 
 
 
387 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.96 
 
 
405 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  44.47 
 
 
396 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  46.54 
 
 
382 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  38.17 
 
 
400 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  43.32 
 
 
415 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  48.78 
 
 
388 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  39.74 
 
 
396 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  45.6 
 
 
390 aa  299  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.45 
 
 
381 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  43.43 
 
 
387 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40.91 
 
 
405 aa  299  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  47.58 
 
 
388 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  46.79 
 
 
396 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  42.89 
 
 
403 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  45.19 
 
 
399 aa  298  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  39.47 
 
 
396 aa  298  9e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  43.27 
 
 
388 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  46.67 
 
 
399 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  46.63 
 
 
389 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  43.24 
 
 
395 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.58 
 
 
406 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  46.67 
 
 
399 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.52 
 
 
381 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  41.55 
 
 
403 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  43.43 
 
 
387 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  43.23 
 
 
395 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  46.47 
 
 
388 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.89 
 
 
386 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  45.43 
 
 
388 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  46.61 
 
 
390 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.58 
 
 
394 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  45.8 
 
 
396 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  43.32 
 
 
399 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  43.29 
 
 
410 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>