More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0302 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  81.19 
 
 		 471 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  75.41 
 
 		 435 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  80.28 
 
 		 471 aa  715    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  81.67 
 
 		 466 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  84.06 
 
 		 435 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  82.48 
 
 		 465 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  85.57 
 
 		 465 aa  725    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  100 
 
 		 437 aa  893    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  80.73 
 
 		 465 aa  718    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  83.09 
 
 		 470 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  59.47 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  56.39 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  57.55 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  51.26 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  47.93 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  50.99 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  50 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  50 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  45.33 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  47.79 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  46.63 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  47.75 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  43.62 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.05 
 
 		 401 aa  306  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  42.63 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.95 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  40.98 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  39.45 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.83 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.89 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  40.86 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  39.55 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  39.7 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  39.69 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.54 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.5 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  37.75 
 
 		 395 aa  276  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  35.92 
 
 		 405 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.12 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.32 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  38.92 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.32 
 
 		 403 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.75 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  38.96 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  38.92 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.7 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.46 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  40.25 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.99 
 
 		 405 aa  270  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.53 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  37.44 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.78 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.44 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.27 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  38.06 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.83 
 
 		 405 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  36.08 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  40.71 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  35.66 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.6 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.4 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  35.9 
 
 		 408 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  37.28 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.26 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41.97 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  36.97 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.17 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.98 
 
 		 404 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  35.84 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  39.85 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  37.25 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  37.38 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  38.57 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  37.24 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.53 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  37.66 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  37.16 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.79 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  37.53 
 
 		 388 aa  255  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.15 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  39.48 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  41.13 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  37.75 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.88 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37.62 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  35.59 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  35.96 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  39.13 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  38.83 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  40.05 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  37.16 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  37.09 
 
 		 381 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  37.65 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.19 
 
 		 387 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.63 
 
 		 381 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.86 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  38.02 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.05 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  36.96 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.1 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>