More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1330 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  79.4 
 
 
405 aa  674    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  100 
 
 
407 aa  840    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  76.43 
 
 
404 aa  631  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  70.12 
 
 
407 aa  598  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  67.84 
 
 
409 aa  579  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  61.89 
 
 
410 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  59.6 
 
 
408 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  45.45 
 
 
400 aa  342  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  42.97 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  42.24 
 
 
391 aa  329  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.33 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  42.03 
 
 
397 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.05 
 
 
401 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  41.48 
 
 
395 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.78 
 
 
391 aa  299  6e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.62 
 
 
390 aa  298  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.22 
 
 
390 aa  292  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.24 
 
 
402 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  40.62 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  41.62 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  42.26 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.34 
 
 
415 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.18 
 
 
394 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.67 
 
 
390 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  38.11 
 
 
391 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  38.44 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.79 
 
 
393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  40.62 
 
 
387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.62 
 
 
387 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.92 
 
 
437 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  38.17 
 
 
430 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.99 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.17 
 
 
399 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.2 
 
 
389 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  41.1 
 
 
387 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  42.34 
 
 
390 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  42.08 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  40.36 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.05 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.84 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  37.5 
 
 
447 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  40.62 
 
 
387 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  40.84 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 
407 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.59 
 
 
387 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.03 
 
 
396 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  40.89 
 
 
389 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.32 
 
 
466 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  38.58 
 
 
435 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.99 
 
 
438 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.35 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.8 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  39.38 
 
 
387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.01 
 
 
388 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.38 
 
 
394 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  39.9 
 
 
439 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  41.83 
 
 
399 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.59 
 
 
396 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  39.95 
 
 
393 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  39.16 
 
 
393 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  38.3 
 
 
403 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.05 
 
 
393 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  40.21 
 
 
395 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  36.36 
 
 
392 aa  265  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.96 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  37.53 
 
 
397 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  39.27 
 
 
424 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 
389 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  39.38 
 
 
465 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.12 
 
 
431 aa  265  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.32 
 
 
398 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  33.59 
 
 
405 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  36.29 
 
 
399 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.21 
 
 
465 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.11 
 
 
389 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.91 
 
 
400 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  38.22 
 
 
415 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  37.53 
 
 
394 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.21 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  36.27 
 
 
425 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.84 
 
 
381 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  33.76 
 
 
405 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  39.12 
 
 
471 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  38.82 
 
 
396 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  39.23 
 
 
381 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  37.2 
 
 
389 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  39.53 
 
 
402 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37.4 
 
 
398 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  39.12 
 
 
471 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.22 
 
 
401 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  39.9 
 
 
407 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.24 
 
 
397 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  37.53 
 
 
389 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  40.16 
 
 
388 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.92 
 
 
380 aa  260  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  38.83 
 
 
387 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  37.43 
 
 
408 aa  260  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>