More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1324 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  100 
 
 
410 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  67.4 
 
 
408 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  59.8 
 
 
405 aa  513  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  61.89 
 
 
407 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  60.2 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  61.04 
 
 
404 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  61.89 
 
 
407 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  43.59 
 
 
391 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  44.27 
 
 
395 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  46.77 
 
 
400 aa  344  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.72 
 
 
401 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  44.11 
 
 
397 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  43.43 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.35 
 
 
400 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  43.8 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  41.21 
 
 
390 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.14 
 
 
438 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  41.63 
 
 
435 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.76 
 
 
393 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.32 
 
 
391 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  40.72 
 
 
466 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  41.35 
 
 
465 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  41.35 
 
 
465 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.29 
 
 
415 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  39.3 
 
 
398 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  39.3 
 
 
398 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  39.55 
 
 
396 aa  285  8e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40.46 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  40.57 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  40.87 
 
 
465 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.62 
 
 
399 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  40.85 
 
 
431 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  39.29 
 
 
394 aa  279  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  41.25 
 
 
471 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  41.25 
 
 
471 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  40.38 
 
 
439 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  38.81 
 
 
395 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  41.84 
 
 
388 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  39.55 
 
 
437 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  41.25 
 
 
470 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  44.9 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.46 
 
 
391 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.65 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.85 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41.12 
 
 
389 aa  273  5.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.4 
 
 
406 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  40.11 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  38.54 
 
 
404 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.15 
 
 
380 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.74 
 
 
389 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.99 
 
 
400 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  39.01 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.01 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.4 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  39.01 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.01 
 
 
389 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1689  amidohydrolase  39.84 
 
 
385 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  37.66 
 
 
430 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  38.65 
 
 
392 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  38.74 
 
 
389 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.05 
 
 
398 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.22 
 
 
389 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  39.74 
 
 
387 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.49 
 
 
396 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.05 
 
 
398 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  40.1 
 
 
400 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  39.43 
 
 
449 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  39.02 
 
 
389 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.9 
 
 
390 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.86 
 
 
459 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.79 
 
 
388 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.75 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.9 
 
 
399 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  37.6 
 
 
405 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  41.02 
 
 
411 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  37.76 
 
 
392 aa  264  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.63 
 
 
386 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  38.02 
 
 
399 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  40.41 
 
 
390 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  38.75 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.01 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  37.44 
 
 
395 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  41.25 
 
 
435 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
388 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.16 
 
 
403 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.12 
 
 
389 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 
397 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.8 
 
 
401 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  40.94 
 
 
393 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.19 
 
 
381 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.94 
 
 
405 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  37.6 
 
 
403 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  36.18 
 
 
402 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.16 
 
 
379 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  39.3 
 
 
381 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.86 
 
 
381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  39.25 
 
 
381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.54 
 
 
401 aa  259  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.53 
 
 
387 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  38.34 
 
 
425 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>