More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0208 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
397 aa  811    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  56.63 
 
 
394 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  56.7 
 
 
394 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  53.32 
 
 
391 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  53.58 
 
 
391 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  53.32 
 
 
391 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  52.25 
 
 
391 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  53.32 
 
 
391 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  51.85 
 
 
391 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  53.32 
 
 
391 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  52.25 
 
 
391 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  50.27 
 
 
389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  52.38 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  50 
 
 
389 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  49.47 
 
 
389 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  51.19 
 
 
391 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  50.27 
 
 
389 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  48.67 
 
 
389 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  48.67 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  48.67 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  52.71 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  48.67 
 
 
389 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  53.32 
 
 
391 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  48.4 
 
 
389 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  47.61 
 
 
392 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  48.8 
 
 
394 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  46.02 
 
 
402 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  46.39 
 
 
430 aa  336  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  46.05 
 
 
405 aa  332  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  45.24 
 
 
405 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  44.42 
 
 
403 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  42.97 
 
 
390 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  44.35 
 
 
403 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  44.59 
 
 
405 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  44.16 
 
 
403 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.41 
 
 
391 aa  314  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  45.34 
 
 
408 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  43.95 
 
 
405 aa  308  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  44.33 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  42.71 
 
 
387 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  41.13 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  41.13 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  43.7 
 
 
399 aa  298  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.01 
 
 
393 aa  296  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  38.5 
 
 
393 aa  296  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  40.82 
 
 
389 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.89 
 
 
390 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.13 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  43.72 
 
 
389 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1689  amidohydrolase  39.79 
 
 
385 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  45.1 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  43.18 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.58 
 
 
395 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2428  amidohydrolase  41.44 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0637586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  39.12 
 
 
395 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  41.21 
 
 
386 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  43.08 
 
 
399 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  38.07 
 
 
396 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  39.64 
 
 
395 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.8 
 
 
391 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.63 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  39.03 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  39.03 
 
 
398 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  37.18 
 
 
438 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  40.65 
 
 
400 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  41.11 
 
 
398 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  40.36 
 
 
387 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  41.67 
 
 
389 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  36.68 
 
 
390 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  39.59 
 
 
396 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.48 
 
 
408 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.65 
 
 
401 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  40.53 
 
 
381 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  40.36 
 
 
387 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.56 
 
 
380 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  39.74 
 
 
398 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  41.29 
 
 
381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  39.24 
 
 
392 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  41.37 
 
 
381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  40 
 
 
393 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  38.6 
 
 
409 aa  263  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.55 
 
 
381 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  41.13 
 
 
398 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.27 
 
 
388 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  40.44 
 
 
388 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.39 
 
 
394 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  39.27 
 
 
388 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  38.87 
 
 
404 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 
390 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  40 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  39.95 
 
 
410 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  40.42 
 
 
386 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
407 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.22 
 
 
379 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  35.17 
 
 
395 aa  259  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.5 
 
 
391 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.64 
 
 
435 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  39.24 
 
 
381 aa  259  8e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.52 
 
 
396 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  41.21 
 
 
387 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>