More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2147 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  100 
 
 		 398 aa  821    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  95.19 
 
 		 398 aa  760    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  71.62 
 
 		 387 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  59.52 
 
 		 373 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  53.23 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  51.99 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  49.87 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  49.6 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  50.4 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  50.54 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  50.67 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  50.4 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  47.99 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  47.59 
 
 		 386 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  47.72 
 
 		 385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  47.71 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  50.3 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2397  amidohydrolase  43.28 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2354  amidohydrolase  43.28 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  43.01 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  40.69 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.03 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.4 
 
 		 405 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.82 
 
 		 379 aa  286  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  41.99 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  43.08 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  40.16 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.39 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.9 
 
 		 403 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.36 
 
 		 388 aa  276  7e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.86 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  41.27 
 
 		 404 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  41.11 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  38.65 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  39.41 
 
 		 388 aa  265  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.26 
 
 		 405 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  39.49 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  41.55 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  40.11 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  37.95 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.53 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  39.95 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40.05 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  39.58 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  41.36 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.63 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.93 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  37.93 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.79 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  42.36 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  36.43 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  37.63 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  40.05 
 
 		 399 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  39.13 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  37.37 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  38.71 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  39.43 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  37.77 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  40.06 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  40 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.34 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  40.31 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.71 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  39.18 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.57 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  37.99 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  39.53 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  38.95 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  41.4 
 
 		 388 aa  252  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.84 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  35.92 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  40.51 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  36.73 
 
 		 389 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  38.25 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  37.5 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  37.99 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  37.37 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  37.37 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  36.77 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  38.38 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37.98 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  38.73 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  39.95 
 
 		 386 aa  249  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  37.27 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  38.58 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  39.43 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.44 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  40.53 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  38.6 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  34.5 
 
 		 396 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  40.1 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.33 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.27 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  38.2 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  38.95 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.97 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  40.58 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  36.34 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  37.43 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.9 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>