More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3992 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  100 
 
 		 385 aa  788    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  92.43 
 
 		 386 aa  728    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  98.96 
 
 		 385 aa  781    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  89.84 
 
 		 385 aa  715    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  50.94 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  49.2 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  50.53 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  49.2 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  48.67 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  48.94 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  48.4 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  49.07 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  48.4 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  47.72 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  48.08 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  45.9 
 
 		 373 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  48.26 
 
 		 398 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  48.82 
 
 		 343 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2397  amidohydrolase  45.9 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2354  amidohydrolase  45.9 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.24 
 
 		 379 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.82 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.7 
 
 		 381 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.2 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  38.94 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.25 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  37.53 
 
 		 396 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.01 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.86 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  37.47 
 
 		 399 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.31 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.54 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  39.32 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.08 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  37.37 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  35.7 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  40.11 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  37.9 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.46 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  38.11 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.17 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.19 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  37.47 
 
 		 385 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  37.57 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.79 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  37.93 
 
 		 399 aa  242  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.22 
 
 		 395 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.33 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.63 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  37.33 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.08 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  38.13 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.63 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  37.16 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  37.71 
 
 		 389 aa  238  9e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  37.87 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  40.34 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  39.78 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  37.08 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  37.87 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  38.84 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  37.8 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.67 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  39.23 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  39.78 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.89 
 
 		 403 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.61 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  39.34 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  37.33 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  37.37 
 
 		 387 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.39 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  39.39 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.39 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  39.39 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  38.61 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  38.42 
 
 		 406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  37.77 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  35.45 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  36.36 
 
 		 397 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.67 
 
 		 391 aa  235  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  37.78 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.7 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.34 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  37.33 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.91 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.23 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.17 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.03 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  37 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.14 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  39.17 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  37.84 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  36.7 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  39.17 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.17 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0696  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  36.93 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  37.36 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.43 
 
 		 480 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  34.54 
 
 		 387 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.6 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>