More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1188 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  100 
 
 		 387 aa  788    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  71.62 
 
 		 398 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  71.88 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  61.83 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  53.08 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  50.94 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  51.33 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  50.67 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  51.45 
 
 		 386 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  50.65 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  50.27 
 
 		 381 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  49.34 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  50 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  50 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  50.27 
 
 		 381 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  48.81 
 
 		 381 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  50.6 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  44.66 
 
 		 372 aa  322  8e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2354  amidohydrolase  43.82 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2397  amidohydrolase  43.82 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  44.89 
 
 		 381 aa  309  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.53 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.09 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.63 
 
 		 380 aa  282  9e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  43.82 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.26 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  44.27 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.44 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  38.89 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  41.04 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  39.8 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  41.41 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  40.21 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  40.48 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.05 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  40.48 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.96 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.63 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  38.36 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  39.24 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  40.41 
 
 		 398 aa  262  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  40.26 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  39.84 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  41.36 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.51 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.98 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  39.11 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  39.11 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.32 
 
 		 392 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.27 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.37 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  39.9 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  41.41 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  39.43 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.04 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  40.91 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  40.41 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  40.21 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  41.19 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.84 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  35.92 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  40.64 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.41 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  39.89 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  40.44 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.77 
 
 		 389 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  40.94 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  38.99 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.99 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  40.21 
 
 		 407 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  38.52 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  38.95 
 
 		 387 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  36.51 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.95 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.44 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  35.86 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.26 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.98 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.06 
 
 		 405 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  35.4 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  39.27 
 
 		 449 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  34.74 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  37.37 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  38.74 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  41.76 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  41.05 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  40.31 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  40.05 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  40.66 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.5 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  39.28 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  38.74 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  38.83 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  37.77 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  38.75 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  38.32 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.81 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  38.24 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>