More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0207 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  100 
 
 
480 aa  994    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  68.31 
 
 
449 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  61.6 
 
 
438 aa  519  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  54.68 
 
 
459 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  55.45 
 
 
432 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  52.08 
 
 
435 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  55.06 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  49.45 
 
 
465 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  52.62 
 
 
465 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  52.9 
 
 
466 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  47.93 
 
 
437 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  50.75 
 
 
439 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  49.75 
 
 
438 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  52.24 
 
 
465 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  51.59 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  52.24 
 
 
471 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  48.65 
 
 
471 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  47.15 
 
 
470 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  50.7 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  48.66 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  51.45 
 
 
458 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  49.75 
 
 
447 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  49.1 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  42.61 
 
 
405 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  43.67 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  43.67 
 
 
403 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  43.63 
 
 
405 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.54 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.11 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  42.25 
 
 
405 aa  305  8.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  43.22 
 
 
404 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  42.25 
 
 
390 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  40.96 
 
 
394 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  41.78 
 
 
408 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  39.56 
 
 
398 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  40 
 
 
390 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  39.32 
 
 
398 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.85 
 
 
399 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.09 
 
 
388 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  41.48 
 
 
400 aa  286  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.34 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  41.18 
 
 
400 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.97 
 
 
391 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.16 
 
 
379 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  39.9 
 
 
415 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.95 
 
 
393 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40.2 
 
 
396 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.5 
 
 
401 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.92 
 
 
399 aa  277  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  37.38 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.79 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.25 
 
 
407 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.57 
 
 
393 aa  273  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.92 
 
 
381 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.8 
 
 
386 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  38.37 
 
 
402 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  38.25 
 
 
430 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  40.1 
 
 
389 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  36.88 
 
 
400 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.71 
 
 
396 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.88 
 
 
387 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  39.45 
 
 
389 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  38.9 
 
 
394 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.55 
 
 
389 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.15 
 
 
387 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.91 
 
 
380 aa  265  8.999999999999999e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  39.1 
 
 
403 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  39.8 
 
 
388 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.54 
 
 
381 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.25 
 
 
404 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  36.54 
 
 
411 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  40.71 
 
 
382 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.46 
 
 
385 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  39.39 
 
 
394 aa  264  3e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  39.84 
 
 
381 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  37.44 
 
 
388 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  38.58 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.15 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  39.07 
 
 
397 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  39.95 
 
 
396 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.29 
 
 
396 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.7 
 
 
396 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  38.31 
 
 
395 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  39.59 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  38.94 
 
 
397 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.1 
 
 
384 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.7 
 
 
385 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  39.02 
 
 
381 aa  260  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.2 
 
 
385 aa  260  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  39.03 
 
 
381 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  38.01 
 
 
390 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.35 
 
 
396 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.31 
 
 
389 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  39.53 
 
 
402 aa  259  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.5 
 
 
391 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  39.14 
 
 
389 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.6 
 
 
388 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  38.63 
 
 
387 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.19 
 
 
400 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>