More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0220 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  91.91 
 
 
386 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  100 
 
 
385 aa  785    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  89.32 
 
 
385 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  89.84 
 
 
385 aa  715    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  53.08 
 
 
387 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  50.27 
 
 
381 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  50.27 
 
 
381 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  49.73 
 
 
381 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  49.47 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  50.53 
 
 
386 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  49.2 
 
 
381 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  49.2 
 
 
381 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  49.6 
 
 
388 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  47.99 
 
 
373 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  48.63 
 
 
372 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  47.71 
 
 
398 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  48.52 
 
 
398 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  50.29 
 
 
343 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  45.5 
 
 
379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2354  amidohydrolase  45.36 
 
 
373 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2397  amidohydrolase  45.36 
 
 
373 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0113  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.26 
 
 
388 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.33 
 
 
381 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  40.26 
 
 
396 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  40 
 
 
396 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.85 
 
 
399 aa  259  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  39.95 
 
 
396 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  41.1 
 
 
394 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  40.05 
 
 
397 aa  256  5e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.81 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  38.18 
 
 
388 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.18 
 
 
388 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  36.55 
 
 
396 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.43 
 
 
396 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  39.58 
 
 
398 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  39.15 
 
 
399 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.63 
 
 
392 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.47 
 
 
389 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.71 
 
 
405 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  36.65 
 
 
397 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  38.73 
 
 
384 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.22 
 
 
393 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.61 
 
 
403 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  39.63 
 
 
389 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  37.47 
 
 
389 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 
397 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41.29 
 
 
389 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.78 
 
 
395 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  41.5 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  39.39 
 
 
389 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.34 
 
 
391 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  37.89 
 
 
385 aa  245  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.06 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  41.06 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.9 
 
 
403 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.06 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  37.63 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  41.06 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.9 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  38.01 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  38.61 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  39.58 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.07 
 
 
396 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  41.32 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.78 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  38.3 
 
 
390 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.94 
 
 
403 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  40.5 
 
 
391 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.9 
 
 
407 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0696  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.76 
 
 
383 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.21 
 
 
480 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  36.1 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  38.55 
 
 
391 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.6 
 
 
394 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  39.62 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  37.36 
 
 
400 aa  238  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  38.34 
 
 
387 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  37.43 
 
 
395 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  38.02 
 
 
400 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.04 
 
 
387 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  36.81 
 
 
390 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  38.68 
 
 
402 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.6 
 
 
401 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.6 
 
 
401 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  37.31 
 
 
387 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.52 
 
 
405 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.04 
 
 
408 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  38.11 
 
 
387 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.99 
 
 
405 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  39.01 
 
 
406 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  39.89 
 
 
389 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  36.53 
 
 
388 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  37.4 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  38.44 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  33.42 
 
 
390 aa  236  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  39.06 
 
 
389 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  36.81 
 
 
397 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.66 
 
 
391 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  39.89 
 
 
390 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.67 
 
 
400 aa  235  9e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>