More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0190 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  100 
 
 
389 aa  814    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  82.52 
 
 
391 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  82.52 
 
 
391 aa  692    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  42.86 
 
 
403 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  42.86 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  42.93 
 
 
405 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  42.74 
 
 
390 aa  315  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  41.53 
 
 
405 aa  314  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  44.15 
 
 
405 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  41.1 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  40.53 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  42.41 
 
 
403 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  42.42 
 
 
389 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  41.77 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.15 
 
 
389 aa  299  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  40.05 
 
 
391 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  40.11 
 
 
391 aa  295  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.05 
 
 
391 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  41.36 
 
 
389 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.37 
 
 
405 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.11 
 
 
391 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.11 
 
 
391 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  43.2 
 
 
404 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  41.62 
 
 
389 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  40.82 
 
 
397 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  41.36 
 
 
389 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.32 
 
 
391 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.79 
 
 
408 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.57 
 
 
391 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  39.02 
 
 
391 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  40.84 
 
 
389 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  41.1 
 
 
389 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.57 
 
 
391 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  41.88 
 
 
389 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.84 
 
 
389 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  40.84 
 
 
389 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  39.57 
 
 
391 aa  288  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.11 
 
 
391 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.82 
 
 
380 aa  286  4e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  39.63 
 
 
392 aa  285  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2175  amidohydrolase family protein  41.07 
 
 
391 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  40.27 
 
 
400 aa  276  5e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.25 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  39.24 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.87 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  38.3 
 
 
387 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  38.65 
 
 
400 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  38.57 
 
 
387 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.72 
 
 
396 aa  270  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.85 
 
 
391 aa  270  4e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  35.98 
 
 
402 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.86 
 
 
387 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  37.34 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.95 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  37.4 
 
 
397 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36.69 
 
 
396 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.52 
 
 
390 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  37.74 
 
 
393 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 
392 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  38.87 
 
 
395 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.17 
 
 
391 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  37.7 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  37.89 
 
 
384 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  37.14 
 
 
395 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  37.06 
 
 
430 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.14 
 
 
386 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0090  amidohydrolase  38.21 
 
 
392 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 
404 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  37.14 
 
 
390 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0093  amidohydrolase  38.21 
 
 
392 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  35.4 
 
 
404 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  37.23 
 
 
387 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  37.11 
 
 
400 aa  257  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.06 
 
 
390 aa  256  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  36.72 
 
 
394 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  37.6 
 
 
387 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  38.06 
 
 
410 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  37.83 
 
 
381 aa  255  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.22 
 
 
396 aa  255  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  37.11 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  37.04 
 
 
389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  35.8 
 
 
423 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  35.22 
 
 
392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  37.6 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.04 
 
 
413 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  39.04 
 
 
385 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.78 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  38.61 
 
 
415 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.04 
 
 
396 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  37.33 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  35.49 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.04 
 
 
396 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  37.67 
 
 
390 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  35.77 
 
 
387 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  36.73 
 
 
398 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  37.01 
 
 
394 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  39.12 
 
 
395 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.68 
 
 
397 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  39.12 
 
 
395 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.59 
 
 
389 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>