More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2428 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2428  amidohydrolase  100 
 
 
401 aa  818    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0637586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.55 
 
 
405 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  41.44 
 
 
397 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.9 
 
 
403 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.9 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  39.9 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.08 
 
 
394 aa  269  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  40.26 
 
 
394 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  38.92 
 
 
404 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  35.31 
 
 
390 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  38.12 
 
 
405 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.41 
 
 
405 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.59 
 
 
394 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.72 
 
 
405 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  37.6 
 
 
389 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.15 
 
 
391 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  37.47 
 
 
396 aa  257  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  42.08 
 
 
389 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 
408 aa  256  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  38.77 
 
 
394 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.46 
 
 
392 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.3 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  36.81 
 
 
398 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.81 
 
 
398 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  36.63 
 
 
389 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  37.24 
 
 
409 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  40.6 
 
 
424 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37 
 
 
392 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.53 
 
 
391 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.79 
 
 
379 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  39.15 
 
 
395 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.36 
 
 
389 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.36 
 
 
389 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  36.73 
 
 
397 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  36.36 
 
 
389 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  40.75 
 
 
385 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  40.93 
 
 
395 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  36.36 
 
 
389 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  38.58 
 
 
389 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  36.1 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  39.51 
 
 
395 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  36.1 
 
 
389 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  34.67 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.2 
 
 
387 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.41 
 
 
397 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.62 
 
 
395 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.62 
 
 
395 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.62 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.46 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.18 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.9 
 
 
396 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.05 
 
 
395 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  36.36 
 
 
396 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  36.1 
 
 
389 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  36.17 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  41.6 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  36.17 
 
 
391 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  36.1 
 
 
396 aa  242  7e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.03 
 
 
387 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  36.64 
 
 
396 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  38.14 
 
 
387 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  37.63 
 
 
407 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.05 
 
 
384 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.28 
 
 
393 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.35 
 
 
387 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  36.44 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36.62 
 
 
396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.11 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  36.36 
 
 
389 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  35.32 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  39.78 
 
 
387 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.97 
 
 
391 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.29 
 
 
387 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  38.4 
 
 
389 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  38.92 
 
 
387 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.29 
 
 
387 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  37.63 
 
 
396 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  39.73 
 
 
399 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.17 
 
 
391 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  36.08 
 
 
388 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  37.5 
 
 
399 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  34.68 
 
 
393 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  36.44 
 
 
391 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  37.2 
 
 
397 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  31.78 
 
 
393 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  38.57 
 
 
387 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37.11 
 
 
390 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  37.06 
 
 
405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  37.28 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  36.34 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.93 
 
 
401 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  39.78 
 
 
386 aa  235  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.44 
 
 
391 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.44 
 
 
391 aa  235  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  37.06 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.21 
 
 
396 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  37.29 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  35.9 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.62 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>