More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0877 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  100 
 
 
387 aa  794    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  46.07 
 
 
393 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  43.42 
 
 
391 aa  290  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  40.27 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  43.47 
 
 
387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  44.47 
 
 
389 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  42.67 
 
 
387 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  41.18 
 
 
387 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  42.93 
 
 
387 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.47 
 
 
381 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  40.15 
 
 
387 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.95 
 
 
381 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  39.47 
 
 
381 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.73 
 
 
393 aa  275  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.8 
 
 
380 aa  275  9e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  39.47 
 
 
381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  40.49 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  44.24 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  42.05 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  41.62 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  42.05 
 
 
396 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1523  M20/M25/M40 family peptidase  40.05 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000131931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  42.71 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  38.57 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  40.98 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  41.62 
 
 
399 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  42.01 
 
 
389 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  40.41 
 
 
399 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  38.96 
 
 
388 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  41.76 
 
 
411 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  41.98 
 
 
415 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  36.77 
 
 
391 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  41.98 
 
 
396 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  41.98 
 
 
415 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  36.77 
 
 
391 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  40.69 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  39.42 
 
 
397 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.69 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  40.16 
 
 
396 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  38.21 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  43.21 
 
 
389 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  40.31 
 
 
402 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  39.74 
 
 
410 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.27 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  42.25 
 
 
389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  41.32 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  41.44 
 
 
390 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  38.79 
 
 
397 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  41.82 
 
 
388 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.58 
 
 
408 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  41.51 
 
 
389 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  41.29 
 
 
387 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.84 
 
 
391 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  43.2 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  40.84 
 
 
343 aa  262  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  35.47 
 
 
390 aa  262  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  38.96 
 
 
391 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.05 
 
 
397 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 
407 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  41.33 
 
 
390 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  41.24 
 
 
387 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.29 
 
 
391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  42.06 
 
 
384 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  40.72 
 
 
394 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  39.38 
 
 
390 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.84 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.85 
 
 
385 aa  259  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.57 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  38.57 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.57 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  39.73 
 
 
397 aa  258  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  40.98 
 
 
395 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  38.29 
 
 
391 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  40.4 
 
 
387 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  43.72 
 
 
401 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  38.05 
 
 
390 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  40.73 
 
 
389 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41.3 
 
 
403 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  40.74 
 
 
388 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  37.73 
 
 
398 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  36.95 
 
 
407 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  40.16 
 
 
408 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  37.74 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  39.95 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.74 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.84 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  41.58 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  40.48 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  37.99 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  41.07 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.95 
 
 
409 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  38.99 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  40.98 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.27 
 
 
425 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  35.88 
 
 
400 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.61 
 
 
403 aa  252  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  38.16 
 
 
389 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  38.96 
 
 
387 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  38.72 
 
 
389 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  38.1 
 
 
405 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>