More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0146 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  100 
 
 
400 aa  814    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  47.45 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  40.91 
 
 
399 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.18 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  39.18 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  42.43 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.13 
 
 
405 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  41.22 
 
 
390 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  41.67 
 
 
390 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  39.38 
 
 
408 aa  296  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.74 
 
 
405 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  39.69 
 
 
404 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  39.44 
 
 
394 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  40 
 
 
390 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.18 
 
 
405 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  40.21 
 
 
404 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  40.82 
 
 
394 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.73 
 
 
405 aa  286  4e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.83 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.93 
 
 
398 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  40.97 
 
 
391 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  36.93 
 
 
398 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.88 
 
 
400 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.31 
 
 
391 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  38.93 
 
 
391 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.68 
 
 
391 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.53 
 
 
391 aa  279  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  38.93 
 
 
391 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.68 
 
 
391 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.68 
 
 
391 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  40.7 
 
 
449 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  37.72 
 
 
394 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  39.53 
 
 
391 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  38.75 
 
 
391 aa  275  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  39.29 
 
 
394 aa  276  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  39.69 
 
 
389 aa  273  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.94 
 
 
400 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  39.07 
 
 
396 aa  272  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.2 
 
 
389 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  38.56 
 
 
396 aa  271  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  38.56 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  40.06 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.27 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.01 
 
 
403 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.02 
 
 
389 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  38.4 
 
 
393 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  37.72 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  38.27 
 
 
412 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  37.24 
 
 
394 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.93 
 
 
391 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1139  amidohydrolase  41.47 
 
 
385 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  40.67 
 
 
385 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  35.2 
 
 
415 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.5 
 
 
397 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.76 
 
 
389 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  36 
 
 
397 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  39.64 
 
 
394 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  37.76 
 
 
389 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  37.5 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  37.76 
 
 
389 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  37.68 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  37.5 
 
 
389 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37.24 
 
 
392 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.12 
 
 
399 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  40 
 
 
391 aa  262  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.77 
 
 
393 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.18 
 
 
396 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.18 
 
 
399 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.76 
 
 
389 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.96 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  36.29 
 
 
389 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  36.12 
 
 
396 aa  258  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  37.24 
 
 
389 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37 
 
 
396 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  35.5 
 
 
402 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.66 
 
 
401 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  36.79 
 
 
393 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  38.64 
 
 
393 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37 
 
 
396 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.25 
 
 
480 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  37.5 
 
 
389 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  34.5 
 
 
425 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.21 
 
 
391 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  34.6 
 
 
398 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  34.6 
 
 
398 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  34.5 
 
 
401 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.02 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  34.5 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  37.36 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  36.12 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  36.12 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  36.12 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  36.5 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  36.12 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  36.12 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  36.12 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  35.16 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  36.12 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  35.68 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>