More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2314 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
402 aa  812    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  64.36 
 
 
399 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  53.65 
 
 
411 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  52.97 
 
 
410 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  49.36 
 
 
396 aa  350  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  54.79 
 
 
401 aa  349  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  47.07 
 
 
399 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  47.09 
 
 
393 aa  323  3e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  48.45 
 
 
454 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  45.29 
 
 
406 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  45.04 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  48.04 
 
 
394 aa  320  3e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  44.42 
 
 
410 aa  319  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  42.89 
 
 
407 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  43.28 
 
 
423 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  42.48 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  44.99 
 
 
505 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  41.61 
 
 
429 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.81 
 
 
396 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  40.81 
 
 
396 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.63 
 
 
390 aa  279  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  40.81 
 
 
396 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  40.81 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  40.81 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  40.81 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  40.81 
 
 
396 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  41.42 
 
 
394 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  41.42 
 
 
394 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  41.75 
 
 
398 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  41.42 
 
 
394 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  42.05 
 
 
443 aa  276  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  40.36 
 
 
389 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  40.31 
 
 
395 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.05 
 
 
379 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  41.42 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  41.16 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.57 
 
 
388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  41.21 
 
 
399 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.31 
 
 
387 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  42.11 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  40.63 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39.84 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  40.26 
 
 
396 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  41.45 
 
 
388 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  41.03 
 
 
402 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  41.04 
 
 
389 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  39.58 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  37.47 
 
 
397 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  40 
 
 
389 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  39.79 
 
 
399 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  40.05 
 
 
387 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  39.79 
 
 
399 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.36 
 
 
387 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.14 
 
 
400 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  40.31 
 
 
387 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  39.12 
 
 
424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  40.11 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  39.7 
 
 
449 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  39.47 
 
 
396 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  40.21 
 
 
387 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.48 
 
 
385 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.48 
 
 
385 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37.34 
 
 
398 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  39.32 
 
 
397 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  39.53 
 
 
396 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  39.47 
 
 
395 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  37.82 
 
 
396 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.53 
 
 
387 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  39.2 
 
 
395 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  39.27 
 
 
396 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.68 
 
 
385 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  39.07 
 
 
389 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  40.6 
 
 
395 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  39.74 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.05 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  38.89 
 
 
386 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  40.3 
 
 
447 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.21 
 
 
390 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.01 
 
 
387 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.01 
 
 
387 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.66 
 
 
393 aa  260  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  42.05 
 
 
395 aa  260  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  38.94 
 
 
393 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.31 
 
 
388 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  40.05 
 
 
386 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  38.92 
 
 
435 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  39.31 
 
 
388 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  39.64 
 
 
390 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.68 
 
 
466 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  38.58 
 
 
388 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  40.05 
 
 
408 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.1 
 
 
396 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  39.84 
 
 
387 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  38.93 
 
 
390 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  38.82 
 
 
387 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  39.49 
 
 
407 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.53 
 
 
480 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.63 
 
 
391 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  40 
 
 
396 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  38.74 
 
 
387 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>