More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2847 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  100 
 
 		 505 aa  959    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  59.13 
 
 		 406 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  55.38 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  53.56 
 
 		 411 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  46.47 
 
 		 412 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  53.95 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  50.5 
 
 		 399 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  48.6 
 
 		 410 aa  312  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  48.76 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  47.22 
 
 		 407 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  44.9 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  48.87 
 
 		 429 aa  297  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  46.27 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  46.4 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  52.04 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  44.85 
 
 		 399 aa  273  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  46.59 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  44.18 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.52 
 
 		 388 aa  256  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  44.27 
 
 		 385 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  42.01 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  44.01 
 
 		 385 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  37.47 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  37.47 
 
 		 403 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.69 
 
 		 388 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  43.24 
 
 		 394 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.84 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  41.8 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  39.84 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.48 
 
 		 403 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  39.58 
 
 		 395 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  38.74 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.92 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  39.42 
 
 		 395 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  39.42 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  39.42 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  36.87 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.68 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.31 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.41 
 
 		 480 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  37.24 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  38.36 
 
 		 386 aa  230  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.48 
 
 		 405 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.79 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  38.18 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  37.38 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.63 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  39.75 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  38.18 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  30.85 
 
 		 389 aa  228  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  37.62 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  37.6 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  37.92 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  39.61 
 
 		 458 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  41.43 
 
 		 392 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  39.55 
 
 		 427 aa  224  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  39.78 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.13 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.78 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  38.77 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  42.27 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  36.84 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  32.99 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4917  amidohydrolase family protein  34.03 
 
 		 376 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.863248  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  37.88 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  42.42 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.24 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.01 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.08 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  40.64 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  35.18 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  39.46 
 
 		 388 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  39.07 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.68 
 
 		 405 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1139  amidohydrolase  34.28 
 
 		 385 aa  221  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.23 
 
 		 391 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.64 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  40.52 
 
 		 386 aa  220  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  39.84 
 
 		 393 aa  220  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  35.92 
 
 		 404 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.96 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  35.14 
 
 		 380 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  37.37 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.08 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  37.82 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  38.52 
 
 		 447 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  42.16 
 
 		 396 aa  218  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  39.06 
 
 		 391 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  36.5 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  35.7 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  35.68 
 
 		 401 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.29 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.5 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.86 
 
 		 404 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  34.97 
 
 		 396 aa  216  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  38.08 
 
 		 390 aa  216  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  39.33 
 
 		 389 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  37.29 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  38.24 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>