More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1992 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  769    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  55.24 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  53.44 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  53.95 
 
 		 401 aa  332  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  47.81 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  47.68 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  48.04 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  49.05 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.78 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  47.14 
 
 		 393 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  46.51 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  45.82 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.63 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  43.99 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  41.85 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  42.49 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.52 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  39.52 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  42.08 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.26 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.79 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  38.99 
 
 		 405 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.05 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.93 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.26 
 
 		 408 aa  272  7e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  42.64 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  41.94 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.56 
 
 		 405 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.24 
 
 		 438 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.94 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.24 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  45.08 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  41.9 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.39 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  46.4 
 
 		 505 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  39.95 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  40.43 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  43.88 
 
 		 394 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.3 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  38.97 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  39.9 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.38 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.31 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.57 
 
 		 437 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  40.06 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  41.91 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.46 
 
 		 388 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.02 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  36.95 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.75 
 
 		 431 aa  253  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.11 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.84 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.49 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  40.27 
 
 		 404 aa  253  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  35.71 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  39.69 
 
 		 389 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  41.04 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  41.14 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  40.37 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0648  amidohydrolase  45.27 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  40.11 
 
 		 396 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  35.62 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  42.38 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.83 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.63 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  35.97 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.43 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  36.77 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1002  amidohydrolase family protein  36.72 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000070505  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  40 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  38.99 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  42.21 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.94 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  36.29 
 
 		 396 aa  249  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  41.62 
 
 		 396 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  40.62 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  40.17 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  41.19 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  40.9 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  38.56 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  42.94 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.53 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  41.29 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  36.71 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  39.39 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  41.36 
 
 		 385 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  34.84 
 
 		 432 aa  245  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  37.98 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  40.17 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  40.11 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  38.98 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  40.88 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  37.76 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.8 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  34.55 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  39.01 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  36.24 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.42 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  39.01 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>