More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  100 
 
 
406 aa  796    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  57.36 
 
 
396 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  59.13 
 
 
505 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  51.49 
 
 
412 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  54.89 
 
 
454 aa  359  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  50.25 
 
 
407 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  50.76 
 
 
410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  51.94 
 
 
399 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  51.12 
 
 
429 aa  336  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  49.08 
 
 
410 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  45.29 
 
 
402 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  49.23 
 
 
411 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  48.79 
 
 
423 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  46.67 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  45.82 
 
 
394 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  50.82 
 
 
401 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.3 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.52 
 
 
388 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  40.52 
 
 
388 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.57 
 
 
385 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.89 
 
 
396 aa  237  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.31 
 
 
385 aa  237  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.86 
 
 
403 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.19 
 
 
393 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.86 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  37.89 
 
 
403 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.5 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.12 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.28 
 
 
385 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  39.65 
 
 
400 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.16 
 
 
390 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.98 
 
 
387 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  35.42 
 
 
405 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  31.47 
 
 
389 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  36.02 
 
 
438 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.5 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  35.71 
 
 
392 aa  226  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  37.89 
 
 
396 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  37.73 
 
 
387 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.31 
 
 
388 aa  225  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  33.85 
 
 
390 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.34 
 
 
438 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  33.5 
 
 
449 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.18 
 
 
395 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.18 
 
 
395 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  32.99 
 
 
394 aa  223  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  40.26 
 
 
388 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  35.58 
 
 
389 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  37.73 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  34.64 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  37.18 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  37.92 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  34.67 
 
 
437 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  37.98 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  37.4 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  37.17 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  34.26 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  34.55 
 
 
396 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  33.59 
 
 
396 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  37.47 
 
 
387 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  37.47 
 
 
387 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.32 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  37.69 
 
 
390 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  35.86 
 
 
386 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  35.58 
 
 
387 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  34.34 
 
 
435 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  36.79 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  33.33 
 
 
396 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  32.12 
 
 
405 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  32.68 
 
 
423 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  37.28 
 
 
398 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  37.47 
 
 
387 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  36.27 
 
 
390 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  35.89 
 
 
397 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  33.16 
 
 
398 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  35.71 
 
 
396 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  35.6 
 
 
408 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  37.28 
 
 
390 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.53 
 
 
389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  36.55 
 
 
399 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  38.18 
 
 
389 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  35.97 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.79 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  35.49 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  35.38 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  35.71 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  35.48 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.51 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  36.01 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  32.64 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  32.98 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  34.18 
 
 
383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  35.38 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  32.07 
 
 
381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.07 
 
 
381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  37.89 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  34 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  31.89 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  31.73 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  34.54 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>