More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0728 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  100 
 
 
454 aa  890    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  60.76 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  57.87 
 
 
399 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  57.39 
 
 
411 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  55.7 
 
 
410 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  53.49 
 
 
410 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  52.93 
 
 
412 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  54.29 
 
 
406 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  52.45 
 
 
407 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  55.05 
 
 
429 aa  365  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  57.77 
 
 
401 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  50.37 
 
 
423 aa  340  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  50.39 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  46.98 
 
 
402 aa  329  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  48.95 
 
 
394 aa  317  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  52.41 
 
 
505 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  45.4 
 
 
393 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  43.03 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  40.15 
 
 
435 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  40.41 
 
 
465 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.8 
 
 
379 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  40.66 
 
 
466 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  44.86 
 
 
400 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  38.17 
 
 
431 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.3 
 
 
388 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  39.9 
 
 
465 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  39.75 
 
 
449 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.44 
 
 
480 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  45.38 
 
 
394 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.19 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  41.58 
 
 
396 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  39.09 
 
 
437 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.15 
 
 
438 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  40.71 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.1 
 
 
459 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.76 
 
 
400 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  40.4 
 
 
465 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  37.05 
 
 
447 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  39.34 
 
 
438 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  39.48 
 
 
435 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  35.26 
 
 
390 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  40.15 
 
 
471 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  40.15 
 
 
471 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.43 
 
 
387 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.84 
 
 
395 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  40 
 
 
389 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  40.1 
 
 
387 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  36.94 
 
 
387 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  40.15 
 
 
391 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  41.37 
 
 
389 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  40.77 
 
 
391 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  39.9 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
391 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  41.73 
 
 
399 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  41.85 
 
 
390 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  38.37 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  40.6 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.74 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  41.69 
 
 
386 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  40.21 
 
 
387 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.69 
 
 
391 aa  244  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.57 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.84 
 
 
388 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  40.35 
 
 
394 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.85 
 
 
405 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  40.36 
 
 
387 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  37.56 
 
 
389 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  40.84 
 
 
399 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  40.84 
 
 
399 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  38.22 
 
 
395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  38.89 
 
 
470 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  40.21 
 
 
387 aa  240  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  34.55 
 
 
400 aa  239  5e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  41.64 
 
 
396 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.47 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.98 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.05 
 
 
393 aa  238  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  40.8 
 
 
405 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  40.44 
 
 
404 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  37.69 
 
 
387 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  40.22 
 
 
387 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39.14 
 
 
406 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  40.22 
 
 
387 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.57 
 
 
387 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  39.95 
 
 
387 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  40.37 
 
 
398 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  41.1 
 
 
396 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  42.9 
 
 
388 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.97 
 
 
413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  39.09 
 
 
389 aa  236  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.59 
 
 
389 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  38.74 
 
 
404 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.47 
 
 
388 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  39.47 
 
 
388 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  42.66 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  41.1 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.89 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  43.05 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37.77 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  40.31 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>