More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5885 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  100 
 
 		 449 aa  911    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  61.99 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  63.7 
 
 		 458 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  54.22 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  55 
 
 		 459 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  51.59 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  50 
 
 		 465 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  47.6 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  50 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  50.85 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  47.06 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  46.83 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  46.83 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  46.22 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  48.91 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  49.39 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  48.54 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  46.51 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  48.91 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 		 435 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  47.58 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  50.36 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  46.5 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.64 
 
 		 391 aa  298  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.05 
 
 		 405 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  40.88 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  40.88 
 
 		 403 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.15 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  40.39 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.44 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.05 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.47 
 
 		 401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.49 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  40.64 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  42.75 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.13 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40.61 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40.94 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.82 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  41.09 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  39.85 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  41.04 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41.25 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.59 
 
 		 390 aa  272  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  41.16 
 
 		 396 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  42.67 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  42.01 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  42.71 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  40.59 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.48 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  38.05 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.96 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  38.85 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  41.16 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  41.73 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  38.24 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  41.25 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  36.56 
 
 		 404 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.66 
 
 		 400 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.36 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  38.83 
 
 		 415 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.16 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.95 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  38.85 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.74 
 
 		 408 aa  262  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  41.34 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.66 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  41.98 
 
 		 386 aa  260  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  40.1 
 
 		 381 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  39.56 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.64 
 
 		 389 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  39.95 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.41 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  40.3 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.56 
 
 		 399 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  36.52 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  40.39 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  38.6 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.79 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.13 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  38.69 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  40.2 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  39.45 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.79 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  36.63 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.6 
 
 		 381 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  40.59 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  40.2 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  38.22 
 
 		 411 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.79 
 
 		 393 aa  255  9e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  39.8 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  39.8 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  35 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.3 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.63 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>