More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1501 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  100 
 
 
431 aa  868    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  52.01 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  47.79 
 
 
449 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  48.03 
 
 
480 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  48.54 
 
 
459 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  48.38 
 
 
436 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  46.6 
 
 
431 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  44.36 
 
 
435 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  45.73 
 
 
438 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  43.82 
 
 
465 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  49.5 
 
 
447 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  46.06 
 
 
439 aa  359  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  42.17 
 
 
437 aa  359  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  44.72 
 
 
465 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  41.57 
 
 
432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  43.26 
 
 
466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  47.85 
 
 
458 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  46.53 
 
 
449 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  43.52 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  45.39 
 
 
435 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  43.19 
 
 
471 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  42.76 
 
 
465 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  42.96 
 
 
471 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  43.1 
 
 
391 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  43.34 
 
 
393 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.78 
 
 
390 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.01 
 
 
391 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  39.11 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  38.96 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.19 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  39.56 
 
 
402 aa  249  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.15 
 
 
392 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.74 
 
 
391 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  37 
 
 
399 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  36.97 
 
 
396 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  35.7 
 
 
390 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.44 
 
 
398 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.08 
 
 
400 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.44 
 
 
398 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  36.97 
 
 
405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.41 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  37.44 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.88 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.37 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  38.07 
 
 
382 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.15 
 
 
405 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.75 
 
 
403 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.75 
 
 
403 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.93 
 
 
395 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.17 
 
 
406 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.6 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  38.64 
 
 
396 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.84 
 
 
399 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.79 
 
 
401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  36.92 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  37.79 
 
 
425 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  38.27 
 
 
405 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  40.25 
 
 
407 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  38.97 
 
 
395 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  37.72 
 
 
395 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  37.84 
 
 
394 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  37.56 
 
 
396 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  36.71 
 
 
395 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.75 
 
 
407 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.74 
 
 
389 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  37.5 
 
 
391 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  37.37 
 
 
395 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  37.09 
 
 
394 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  37.37 
 
 
395 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  36.48 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  37.83 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  37.37 
 
 
395 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  36.99 
 
 
391 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  38.27 
 
 
395 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  35.87 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  37.5 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  36.46 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  37.83 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.31 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.69 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.88 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  38.27 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.58 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  34.64 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  36.84 
 
 
394 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  36.36 
 
 
412 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  36.87 
 
 
471 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.41 
 
 
413 aa  234  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  40.25 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  36.75 
 
 
389 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  38.22 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.22 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  36.87 
 
 
470 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  35.52 
 
 
396 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  35.52 
 
 
396 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  35.52 
 
 
396 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  37.09 
 
 
394 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  35.52 
 
 
396 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>