More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0853 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
431 aa  878    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  76.33 
 
 
424 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  74.29 
 
 
422 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  75.42 
 
 
420 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  75.43 
 
 
420 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  64.02 
 
 
421 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  61.29 
 
 
425 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  56.34 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  58.43 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  55.16 
 
 
437 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  53.5 
 
 
417 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  53.27 
 
 
416 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  52.52 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  52.3 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  54.63 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  52.06 
 
 
422 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  52.06 
 
 
422 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  57.52 
 
 
427 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  49.14 
 
 
439 aa  403  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  46.08 
 
 
1270 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  51.43 
 
 
575 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  45.45 
 
 
410 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  52.5 
 
 
405 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  47.12 
 
 
443 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  47.04 
 
 
471 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  47.04 
 
 
470 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  46.91 
 
 
437 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  46.89 
 
 
653 aa  332  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.41 
 
 
442 aa  329  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  42.76 
 
 
430 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  42.76 
 
 
430 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  41.5 
 
 
446 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  42.71 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  44.94 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  44.76 
 
 
453 aa  312  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  42.58 
 
 
438 aa  309  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  42.26 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  41.87 
 
 
446 aa  308  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  45.69 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  41.67 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  41.58 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  43 
 
 
428 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  44.5 
 
 
437 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  43.91 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  42.08 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  38.73 
 
 
419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  44.84 
 
 
406 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  45.73 
 
 
394 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  45.73 
 
 
394 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  45.73 
 
 
394 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  45.45 
 
 
394 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  44.54 
 
 
389 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  45.18 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  44.84 
 
 
394 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  44.84 
 
 
405 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  44.63 
 
 
394 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  44.54 
 
 
391 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  45.1 
 
 
389 aa  256  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.7 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  44.26 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.88 
 
 
465 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.83 
 
 
465 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.19 
 
 
439 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  43.06 
 
 
387 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.84 
 
 
412 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  41.15 
 
 
458 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  42.36 
 
 
396 aa  249  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  43.06 
 
 
390 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.56 
 
 
438 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  44.93 
 
 
391 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  37.41 
 
 
437 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.11 
 
 
396 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  41.31 
 
 
480 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  42.94 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  39.7 
 
 
459 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  42.54 
 
 
396 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  42.54 
 
 
396 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  42.54 
 
 
396 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  42.54 
 
 
396 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  42.54 
 
 
396 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.54 
 
 
396 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  42.54 
 
 
396 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  41.23 
 
 
384 aa  245  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.87 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  45.27 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.05 
 
 
388 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.59 
 
 
466 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  42.86 
 
 
393 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  42.65 
 
 
387 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  42.07 
 
 
387 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.07 
 
 
387 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.07 
 
 
387 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  45.98 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  39.15 
 
 
435 aa  239  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  37.62 
 
 
396 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  40.25 
 
 
436 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  45.27 
 
 
396 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  42.07 
 
 
387 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  43.14 
 
 
393 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>