More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1971 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  100 
 
 
420 aa  851    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  88.12 
 
 
421 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  72.57 
 
 
422 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  72.57 
 
 
422 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  72.57 
 
 
422 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  64.79 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  53.1 
 
 
424 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  52.26 
 
 
421 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  51.25 
 
 
425 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  54.63 
 
 
431 aa  418  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  55 
 
 
420 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  54.59 
 
 
420 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  52.27 
 
 
422 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  53.02 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  50.83 
 
 
1270 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  47.36 
 
 
439 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  50.85 
 
 
416 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  49.44 
 
 
367 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  43.61 
 
 
410 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  48.71 
 
 
450 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  50.12 
 
 
427 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  51.39 
 
 
405 aa  341  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  50 
 
 
575 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  44.52 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  41.88 
 
 
438 aa  305  8.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  46.04 
 
 
430 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.86 
 
 
442 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  40.2 
 
 
470 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  45.05 
 
 
430 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  43.32 
 
 
437 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  40.2 
 
 
471 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  45.26 
 
 
444 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  44.78 
 
 
438 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  47.46 
 
 
426 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  46.19 
 
 
653 aa  289  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  41.38 
 
 
441 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  40.45 
 
 
446 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  42.26 
 
 
453 aa  279  7e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  42.86 
 
 
419 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  45.14 
 
 
426 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  39.4 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  45.22 
 
 
428 aa  273  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  40.99 
 
 
445 aa  262  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  37.59 
 
 
447 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  41.46 
 
 
406 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  42.35 
 
 
437 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.5 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  41.94 
 
 
389 aa  239  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  41.36 
 
 
458 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  44.67 
 
 
389 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  40.66 
 
 
449 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  42.58 
 
 
399 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  42.45 
 
 
391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  42.19 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  39.85 
 
 
389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  40.4 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  40.1 
 
 
405 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.24 
 
 
412 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  40.34 
 
 
465 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  43.6 
 
 
387 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  43.47 
 
 
387 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  43.16 
 
 
387 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.93 
 
 
403 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.11 
 
 
390 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  43.34 
 
 
384 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.78 
 
 
439 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  40.1 
 
 
465 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  39.7 
 
 
419 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  36.93 
 
 
459 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  41.62 
 
 
387 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  42.2 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  42.08 
 
 
389 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  40.31 
 
 
447 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  42.42 
 
 
395 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  37.96 
 
 
436 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.56 
 
 
435 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.73 
 
 
399 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  43.33 
 
 
387 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.89 
 
 
480 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.04 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.73 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.73 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  42.42 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  41.05 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  40.52 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  39.88 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.88 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.78 
 
 
385 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.84 
 
 
385 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.96 
 
 
388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  43.61 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  42.47 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  36.19 
 
 
383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.78 
 
 
385 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  36.19 
 
 
383 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  37.12 
 
 
432 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  40.61 
 
 
392 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  40.98 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  42.47 
 
 
399 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.45 
 
 
431 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>