More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4743 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  88.12 
 
 
420 aa  736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  100 
 
 
421 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  72.3 
 
 
422 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  72.3 
 
 
422 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  72.3 
 
 
422 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  63.98 
 
 
437 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  50.63 
 
 
425 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  50.88 
 
 
421 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  52.52 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  50.48 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  54 
 
 
420 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  53.16 
 
 
420 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  51.21 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  52.26 
 
 
417 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  51.5 
 
 
1270 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  44.39 
 
 
410 aa  376  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  51.34 
 
 
416 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  48.83 
 
 
450 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  51.57 
 
 
427 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  49.3 
 
 
367 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  44.44 
 
 
439 aa  358  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  52.9 
 
 
405 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  50 
 
 
575 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  43.75 
 
 
443 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  42.29 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.61 
 
 
442 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  48.12 
 
 
426 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  40.96 
 
 
437 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  44.04 
 
 
430 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  44.21 
 
 
444 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  44.44 
 
 
430 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  38.44 
 
 
471 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  38.44 
 
 
470 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  42.29 
 
 
438 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  43.1 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  44.79 
 
 
653 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  45.75 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  38.5 
 
 
441 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  39.21 
 
 
446 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  41.52 
 
 
453 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  38.33 
 
 
446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  41.78 
 
 
428 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  37.77 
 
 
445 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  37.75 
 
 
447 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  42.52 
 
 
458 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  40.7 
 
 
406 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  40.87 
 
 
437 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.2 
 
 
391 aa  247  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  39.66 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  41.67 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  40.48 
 
 
391 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  39.75 
 
 
449 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  40.48 
 
 
391 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  38.88 
 
 
389 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
391 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  43.16 
 
 
387 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  43.39 
 
 
389 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  42.86 
 
 
387 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  42.68 
 
 
387 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  42.34 
 
 
412 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.11 
 
 
403 aa  227  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  42.08 
 
 
389 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.5 
 
 
465 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  37.16 
 
 
459 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.11 
 
 
399 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.19 
 
 
390 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.26 
 
 
465 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  43.61 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  40.5 
 
 
385 aa  223  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  42.42 
 
 
387 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  38.06 
 
 
419 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  34.97 
 
 
393 aa  222  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  40.75 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  40.5 
 
 
385 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.67 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.53 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  38.08 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  41.82 
 
 
387 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  41.82 
 
 
387 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  39.8 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  40.92 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  35.91 
 
 
383 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  38.74 
 
 
385 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.19 
 
 
390 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  40.27 
 
 
392 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  37.19 
 
 
439 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  35.91 
 
 
383 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  36.83 
 
 
432 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  40.45 
 
 
438 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  37.77 
 
 
425 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.43 
 
 
480 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.29 
 
 
466 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  35.91 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.48 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  37.71 
 
 
447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  41.52 
 
 
387 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.34 
 
 
431 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.88 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  37.62 
 
 
437 aa  216  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  38.89 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>