More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3698 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  100 
 
 
437 aa  850    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  57.56 
 
 
426 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  53.22 
 
 
442 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  57.32 
 
 
426 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 
420 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  47.54 
 
 
420 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  47.06 
 
 
575 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  45.45 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  49.39 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  44.47 
 
 
431 aa  310  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  45.32 
 
 
422 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  43.49 
 
 
443 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  39.86 
 
 
446 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  41.28 
 
 
421 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  43.6 
 
 
450 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  45.26 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  38.44 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  39.31 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  40.92 
 
 
419 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  39.02 
 
 
439 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  38.98 
 
 
441 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  39.71 
 
 
1270 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  41.11 
 
 
445 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  42.04 
 
 
422 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  42.04 
 
 
422 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  42.04 
 
 
422 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  42.93 
 
 
653 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  42.03 
 
 
453 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  40.44 
 
 
417 aa  272  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  40.71 
 
 
367 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  38.14 
 
 
438 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  37.11 
 
 
471 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  41.85 
 
 
420 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  37.56 
 
 
470 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  42.79 
 
 
416 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  40.05 
 
 
421 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  44.97 
 
 
438 aa  256  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  41.39 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  39.8 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  41.15 
 
 
430 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  41.02 
 
 
405 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  39.95 
 
 
444 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  42.89 
 
 
427 aa  246  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  34.89 
 
 
410 aa  244  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  34.97 
 
 
447 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  39.61 
 
 
428 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  40.41 
 
 
394 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  45.61 
 
 
389 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  40.29 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  35.8 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  39.41 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  39.53 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  37.64 
 
 
384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  33.26 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  41.16 
 
 
399 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.3 
 
 
394 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  34.4 
 
 
480 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.21 
 
 
388 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  38.82 
 
 
394 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  38.82 
 
 
394 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 
394 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.81 
 
 
396 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  36.8 
 
 
395 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  38.28 
 
 
396 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.99 
 
 
389 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  39.94 
 
 
395 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  39.05 
 
 
396 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  39.94 
 
 
395 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.23 
 
 
395 aa  190  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  38.24 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.16 
 
 
379 aa  189  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  38.12 
 
 
397 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.41 
 
 
438 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  31.65 
 
 
449 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  38.62 
 
 
393 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  33.02 
 
 
439 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  36.56 
 
 
395 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.89 
 
 
387 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  37.13 
 
 
387 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  46.64 
 
 
373 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  36.89 
 
 
387 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  34.88 
 
 
391 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.65 
 
 
387 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  34.12 
 
 
465 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.65 
 
 
387 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.23 
 
 
395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  39.02 
 
 
396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  32.7 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  41.35 
 
 
395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  33.89 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  43.53 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  34.59 
 
 
449 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.62 
 
 
390 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  40.54 
 
 
396 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>