More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3605 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  73.87 
 
 		 441 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  76.58 
 
 		 446 aa  702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  71.53 
 
 		 445 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  100 
 
 		 446 aa  910    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  49.76 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  48.37 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  48.26 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  49.76 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  48.14 
 
 		 453 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  45.79 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  46.65 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  45.22 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  44.34 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  41.33 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  40.78 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.03 
 
 		 471 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  42.26 
 
 		 420 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  41.63 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  41.15 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  41.5 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  41.56 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  41.87 
 
 		 421 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  38.86 
 
 		 1270 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  39.9 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  39.03 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  40.33 
 
 		 422 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  41.95 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  42.68 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  42.93 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  42.68 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  40.88 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  43.28 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  39.77 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  40.83 
 
 		 405 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  41.3 
 
 		 575 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  43.42 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  38.33 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  38.92 
 
 		 410 aa  270  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  40.29 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  40.45 
 
 		 420 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  39.21 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  40 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.77 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  36.38 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  40 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  38.26 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  38.63 
 
 		 653 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  40.65 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  35.81 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.96 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  37.41 
 
 		 419 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.04 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  38.01 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.18 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.18 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  36.22 
 
 		 466 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.94 
 
 		 480 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.31 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.06 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  35.96 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  39.49 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.14 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.61 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  36.04 
 
 		 465 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  35.82 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  35.98 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  35.6 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.7 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  37.07 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  40 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  39.77 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.24 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  38.12 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.8 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.35 
 
 		 389 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.03 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  34.53 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.97 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  42.91 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.26 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.26 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  37.6 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  37.64 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.21 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.89 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  37.2 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37.96 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  36.98 
 
 		 470 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.97 
 
 		 387 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  39.02 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  40.33 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.97 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.87 
 
 		 405 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  36.98 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  38.44 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  34.31 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  34.31 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  40.77 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  41.43 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>