More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0854 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 438 aa  901    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  68.51 
 
 		 444 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  67.4 
 
 		 438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  58.53 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  53.1 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  51.96 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  48.37 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  48.46 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  49.08 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  50.7 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.2 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  43.44 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  45.23 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  44.74 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  43.77 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  43.73 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  41.69 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  42.76 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  42.71 
 
 		 431 aa  302  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  41.86 
 
 		 439 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  44.42 
 
 		 422 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  44.42 
 
 		 422 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  44.16 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  40.39 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  40.9 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  41.4 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  39.9 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  41.09 
 
 		 1270 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  40.2 
 
 		 417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  41.88 
 
 		 420 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  42.29 
 
 		 421 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  40.64 
 
 		 422 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  42.51 
 
 		 437 aa  272  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  41.43 
 
 		 416 aa  272  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  41.15 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  39.68 
 
 		 450 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  40.15 
 
 		 442 aa  265  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  40.24 
 
 		 575 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  41.32 
 
 		 367 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  42 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  41.34 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  40.84 
 
 		 426 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  37.34 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  36.82 
 
 		 653 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  42.53 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38.13 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  39.94 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.94 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.17 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  38.54 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  36.51 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.22 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  36.45 
 
 		 465 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  40.6 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.19 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  43.94 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  36.14 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.18 
 
 		 466 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  36.98 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  36.3 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  41.58 
 
 		 399 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.83 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.47 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  35.32 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.71 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.94 
 
 		 439 aa  223  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  37.22 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  35.28 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  38.95 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  34.5 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.94 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  39.24 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  39.24 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  39.24 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  38.66 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  39.24 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  36.28 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  33.49 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  37.96 
 
 		 459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  43.97 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  36.24 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.06 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  38.92 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.98 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  37.15 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  39.77 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  36 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.18 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  37.44 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  36.73 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  37.15 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  37.79 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  39.47 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  36.54 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>