More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2928 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  74.31 
 
 		 446 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  71.26 
 
 		 445 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  100 
 
 		 441 aa  903    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  73.87 
 
 		 446 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  52.09 
 
 		 438 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  51.96 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  47.25 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  48.81 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  48.76 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  47 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  47.34 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  46.14 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  42.12 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  42.72 
 
 		 419 aa  329  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  41.29 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.29 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  40.24 
 
 		 417 aa  305  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  41.59 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  40.59 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  40.35 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  41.58 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  39.16 
 
 		 1270 aa  289  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  39.66 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  39.86 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  39.21 
 
 		 421 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  41.41 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  41.16 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  41.16 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  40.6 
 
 		 442 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  41.98 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  39.66 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  41.12 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  38.48 
 
 		 416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  41.71 
 
 		 575 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  39.49 
 
 		 450 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  41.38 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  38.5 
 
 		 421 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  38.44 
 
 		 653 aa  253  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.11 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  38.89 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  38 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  39.07 
 
 		 437 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  36.97 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  36.06 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  40.9 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.15 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  39.36 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  42.23 
 
 		 400 aa  242  1e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  36.12 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  42.27 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.02 
 
 		 465 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.02 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  40.59 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.14 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.92 
 
 		 459 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  43.57 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  35.4 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  37.25 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  36.38 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  35.65 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  35.95 
 
 		 465 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.28 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  37.17 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  37.36 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  35.73 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.31 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  34.3 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  41.04 
 
 		 395 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.06 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.88 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  41.52 
 
 		 399 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  39.72 
 
 		 393 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  39.59 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.4 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.68 
 
 		 387 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  39.88 
 
 		 389 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.68 
 
 		 387 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  35.75 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  38.4 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  36.87 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.71 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  38.46 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  33.81 
 
 		 398 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  34.53 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  34.76 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  36.83 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.11 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  36.99 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  33.57 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  35.59 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.12 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.11 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  39.13 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  34.51 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  42.86 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  34.76 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>