More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  100 
 
 		 405 aa  790    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  58.06 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  59.1 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  53.75 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  51.87 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  53.5 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  52.5 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  54.22 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  54.22 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  53.96 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  50.87 
 
 		 422 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  48.75 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  47.5 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  50.84 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  53.48 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  52.9 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  47.68 
 
 		 1270 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  47.37 
 
 		 439 aa  364  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  51.39 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  53.45 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  44.55 
 
 		 471 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  48.47 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  44.55 
 
 		 470 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  48.88 
 
 		 575 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  47.04 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  46.39 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  46.21 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  46.61 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  40.69 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  42.17 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  41.77 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  41.28 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  40.93 
 
 		 441 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  46.68 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  41.4 
 
 		 438 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  43.8 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.55 
 
 		 430 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  43.64 
 
 		 437 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  48.11 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  44.64 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  47.36 
 
 		 426 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  38.08 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  43.46 
 
 		 653 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  39.85 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  45.04 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  43.75 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  41.87 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  44.08 
 
 		 389 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.2 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.24 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.52 
 
 		 466 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.27 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  40.6 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  44.57 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.02 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  44.07 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  43.79 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  43.06 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  42.82 
 
 		 399 aa  236  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  43.28 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  42.56 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  42.51 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  38.78 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  37.72 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  42.09 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  43.03 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  48.49 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  37.8 
 
 		 471 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.09 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.09 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  38.54 
 
 		 465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  41.92 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  40.59 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  42.66 
 
 		 389 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.91 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.89 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.42 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  43.07 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  41.62 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  46.15 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  44.26 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  41.08 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  42.39 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  37.56 
 
 		 470 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  41.06 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.56 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.74 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.14 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  40.05 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.58 
 
 		 390 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  39.47 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  39.84 
 
 		 402 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  36.25 
 
 		 432 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  38.89 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  40.06 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  41 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.37 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  41.19 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  38.95 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>