More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00571 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 432 aa  892    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  55.45 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  54.32 
 
 		 449 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  51.96 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  48.23 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  50.49 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  46.56 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  46.38 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  45.33 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  46.01 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  45.81 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  46.27 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  45.77 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  44.82 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  45.31 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  46.51 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  45.69 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  45.22 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  44.01 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  44.27 
 
 		 458 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  44.91 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  43.52 
 
 		 436 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  43.04 
 
 		 431 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  39.66 
 
 		 403 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.42 
 
 		 403 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  40 
 
 		 390 aa  286  7e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  36.95 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  39.4 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.71 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.52 
 
 		 401 aa  279  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 		 407 aa  279  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.08 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  39.22 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  40.46 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.47 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.65 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  37.91 
 
 		 397 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.12 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  38.42 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.22 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  36.74 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  38.25 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.84 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.39 
 
 		 393 aa  265  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.68 
 
 		 391 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  37.47 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.85 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.7 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.12 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.03 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  36.09 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  37.37 
 
 		 415 aa  260  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  35.32 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.34 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  36.63 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.39 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  37.41 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  35.08 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.44 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.78 
 
 		 399 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  38.54 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  37.56 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.89 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  37.44 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.06 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  36.8 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.63 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  33.66 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.22 
 
 		 396 aa  253  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.48 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.61 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  36.25 
 
 		 386 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  34.79 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  35.45 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  36.62 
 
 		 381 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  35.1 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  36.03 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  38.54 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  36.97 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  35.81 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  37.03 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  34.89 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  36.63 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  37.16 
 
 		 389 aa  246  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  35.35 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  34.84 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  37.28 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  38.5 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.68 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.68 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.1 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.85 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  35.86 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  35.43 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  37.5 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  34.86 
 
 		 413 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  36.92 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  35.62 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  38.61 
 
 		 387 aa  242  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>